Protein–RNA interactions for Protein: Q3TBN1

Tmem248, Transmembrane protein 248, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem248Q3TBN1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem248Q3TBN1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem248Q3TBN1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem248Q3TBN1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem248Q3TBN1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem248Q3TBN1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem248Q3TBN1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem248Q3TBN1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem248Q3TBN1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem248Q3TBN1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem248Q3TBN1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem248Q3TBN1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem248Q3TBN1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem248Q3TBN1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem248Q3TBN1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem248Q3TBN1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem248Q3TBN1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem248Q3TBN1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem248Q3TBN1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem248Q3TBN1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem248Q3TBN1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem248Q3TBN1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem248Q3TBN1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem248Q3TBN1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem248Q3TBN1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem248Q3TBN1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem248Q3TBN1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem248Q3TBN1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem248Q3TBN1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem248Q3TBN1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem248Q3TBN1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem248Q3TBN1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem248Q3TBN1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem248Q3TBN1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem248Q3TBN1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem248Q3TBN1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem248Q3TBN1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem248Q3TBN1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem248Q3TBN1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem248Q3TBN1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem248Q3TBN1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem248Q3TBN1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem248Q3TBN1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem248Q3TBN1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem248Q3TBN1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem248Q3TBN1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tmem248Q3TBN1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem248Q3TBN1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem248Q3TBN1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem248Q3TBN1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem248Q3TBN1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem248Q3TBN1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem248Q3TBN1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem248Q3TBN1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem248Q3TBN1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem248Q3TBN1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem248Q3TBN1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem248Q3TBN1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem248Q3TBN1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem248Q3TBN1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem248Q3TBN1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem248Q3TBN1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem248Q3TBN1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem248Q3TBN1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem248Q3TBN1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem248Q3TBN1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem248Q3TBN1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem248Q3TBN1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem248Q3TBN1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem248Q3TBN1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem248Q3TBN1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem248Q3TBN1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem248Q3TBN1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem248Q3TBN1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem248Q3TBN1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem248Q3TBN1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem248Q3TBN1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem248Q3TBN1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem248Q3TBN1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem248Q3TBN1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem248Q3TBN1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem248Q3TBN1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem248Q3TBN1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem248Q3TBN1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem248Q3TBN1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem248Q3TBN1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem248Q3TBN1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem248Q3TBN1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem248Q3TBN1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem248Q3TBN1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem248Q3TBN1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem248Q3TBN1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem248Q3TBN1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem248Q3TBN1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem248Q3TBN1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem248Q3TBN1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem248Q3TBN1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem248Q3TBN1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem248Q3TBN1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem248Q3TBN1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms