Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccbe1Q3MI99 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccbe1Q3MI99 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccbe1Q3MI99 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccbe1Q3MI99 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccbe1Q3MI99 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccbe1Q3MI99 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccbe1Q3MI99 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccbe1Q3MI99 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccbe1Q3MI99 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccbe1Q3MI99 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccbe1Q3MI99 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccbe1Q3MI99 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccbe1Q3MI99 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccbe1Q3MI99 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccbe1Q3MI99 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccbe1Q3MI99 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccbe1Q3MI99 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccbe1Q3MI99 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccbe1Q3MI99 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccbe1Q3MI99 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccbe1Q3MI99 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccbe1Q3MI99 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccbe1Q3MI99 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccbe1Q3MI99 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccbe1Q3MI99 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccbe1Q3MI99 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccbe1Q3MI99 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccbe1Q3MI99 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccbe1Q3MI99 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccbe1Q3MI99 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccbe1Q3MI99 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccbe1Q3MI99 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccbe1Q3MI99 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccbe1Q3MI99 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccbe1Q3MI99 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccbe1Q3MI99 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccbe1Q3MI99 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccbe1Q3MI99 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccbe1Q3MI99 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccbe1Q3MI99 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccbe1Q3MI99 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccbe1Q3MI99 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccbe1Q3MI99 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccbe1Q3MI99 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccbe1Q3MI99 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccbe1Q3MI99 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccbe1Q3MI99 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccbe1Q3MI99 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccbe1Q3MI99 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccbe1Q3MI99 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccbe1Q3MI99 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccbe1Q3MI99 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccbe1Q3MI99 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccbe1Q3MI99 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccbe1Q3MI99 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccbe1Q3MI99 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccbe1Q3MI99 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccbe1Q3MI99 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccbe1Q3MI99 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccbe1Q3MI99 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccbe1Q3MI99 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccbe1Q3MI99 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccbe1Q3MI99 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccbe1Q3MI99 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccbe1Q3MI99 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccbe1Q3MI99 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccbe1Q3MI99 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccbe1Q3MI99 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccbe1Q3MI99 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccbe1Q3MI99 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccbe1Q3MI99 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccbe1Q3MI99 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccbe1Q3MI99 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccbe1Q3MI99 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccbe1Q3MI99 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccbe1Q3MI99 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccbe1Q3MI99 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccbe1Q3MI99 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccbe1Q3MI99 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccbe1Q3MI99 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccbe1Q3MI99 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccbe1Q3MI99 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccbe1Q3MI99 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccbe1Q3MI99 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccbe1Q3MI99 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccbe1Q3MI99 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccbe1Q3MI99 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccbe1Q3MI99 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccbe1Q3MI99 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccbe1Q3MI99 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccbe1Q3MI99 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccbe1Q3MI99 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccbe1Q3MI99 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccbe1Q3MI99 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccbe1Q3MI99 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccbe1Q3MI99 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccbe1Q3MI99 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccbe1Q3MI99 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccbe1Q3MI99 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms