Protein–RNA interactions for Protein: Q30D77

Col24a1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col24a1Q30D77 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col24a1Q30D77 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col24a1Q30D77 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col24a1Q30D77 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col24a1Q30D77 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col24a1Q30D77 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col24a1Q30D77 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col24a1Q30D77 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col24a1Q30D77 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col24a1Q30D77 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col24a1Q30D77 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col24a1Q30D77 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col24a1Q30D77 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col24a1Q30D77 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col24a1Q30D77 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col24a1Q30D77 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col24a1Q30D77 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col24a1Q30D77 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col24a1Q30D77 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Col24a1Q30D77 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col24a1Q30D77 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col24a1Q30D77 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col24a1Q30D77 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col24a1Q30D77 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col24a1Q30D77 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col24a1Q30D77 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col24a1Q30D77 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col24a1Q30D77 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col24a1Q30D77 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col24a1Q30D77 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Col24a1Q30D77 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col24a1Q30D77 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col24a1Q30D77 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col24a1Q30D77 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Col24a1Q30D77 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col24a1Q30D77 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col24a1Q30D77 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col24a1Q30D77 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col24a1Q30D77 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col24a1Q30D77 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col24a1Q30D77 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col24a1Q30D77 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col24a1Q30D77 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col24a1Q30D77 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col24a1Q30D77 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col24a1Q30D77 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col24a1Q30D77 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col24a1Q30D77 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col24a1Q30D77 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Col24a1Q30D77 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col24a1Q30D77 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col24a1Q30D77 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col24a1Q30D77 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col24a1Q30D77 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col24a1Q30D77 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col24a1Q30D77 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col24a1Q30D77 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col24a1Q30D77 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col24a1Q30D77 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col24a1Q30D77 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col24a1Q30D77 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col24a1Q30D77 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col24a1Q30D77 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col24a1Q30D77 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col24a1Q30D77 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col24a1Q30D77 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col24a1Q30D77 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col24a1Q30D77 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col24a1Q30D77 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Col24a1Q30D77 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col24a1Q30D77 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col24a1Q30D77 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col24a1Q30D77 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Col24a1Q30D77 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col24a1Q30D77 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col24a1Q30D77 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col24a1Q30D77 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col24a1Q30D77 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col24a1Q30D77 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col24a1Q30D77 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col24a1Q30D77 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col24a1Q30D77 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col24a1Q30D77 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col24a1Q30D77 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col24a1Q30D77 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col24a1Q30D77 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col24a1Q30D77 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col24a1Q30D77 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col24a1Q30D77 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col24a1Q30D77 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col24a1Q30D77 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col24a1Q30D77 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col24a1Q30D77 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col24a1Q30D77 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col24a1Q30D77 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col24a1Q30D77 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col24a1Q30D77 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col24a1Q30D77 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col24a1Q30D77 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Col24a1Q30D77 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms