Protein–RNA interactions for Protein: Q24JP3

Fam178b, Protein FAM178B, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam178bQ24JP3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam178bQ24JP3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam178bQ24JP3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam178bQ24JP3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam178bQ24JP3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam178bQ24JP3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam178bQ24JP3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam178bQ24JP3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam178bQ24JP3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam178bQ24JP3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam178bQ24JP3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam178bQ24JP3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam178bQ24JP3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam178bQ24JP3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam178bQ24JP3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam178bQ24JP3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam178bQ24JP3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam178bQ24JP3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam178bQ24JP3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam178bQ24JP3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam178bQ24JP3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam178bQ24JP3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam178bQ24JP3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam178bQ24JP3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam178bQ24JP3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam178bQ24JP3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam178bQ24JP3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam178bQ24JP3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam178bQ24JP3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam178bQ24JP3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam178bQ24JP3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam178bQ24JP3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam178bQ24JP3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam178bQ24JP3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam178bQ24JP3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam178bQ24JP3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam178bQ24JP3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam178bQ24JP3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam178bQ24JP3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam178bQ24JP3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam178bQ24JP3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam178bQ24JP3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam178bQ24JP3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam178bQ24JP3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam178bQ24JP3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam178bQ24JP3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam178bQ24JP3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam178bQ24JP3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam178bQ24JP3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam178bQ24JP3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam178bQ24JP3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam178bQ24JP3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam178bQ24JP3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam178bQ24JP3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam178bQ24JP3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam178bQ24JP3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam178bQ24JP3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam178bQ24JP3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam178bQ24JP3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam178bQ24JP3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam178bQ24JP3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam178bQ24JP3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam178bQ24JP3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam178bQ24JP3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam178bQ24JP3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam178bQ24JP3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam178bQ24JP3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam178bQ24JP3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam178bQ24JP3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam178bQ24JP3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam178bQ24JP3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam178bQ24JP3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam178bQ24JP3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam178bQ24JP3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam178bQ24JP3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam178bQ24JP3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam178bQ24JP3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam178bQ24JP3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam178bQ24JP3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam178bQ24JP3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam178bQ24JP3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam178bQ24JP3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam178bQ24JP3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam178bQ24JP3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam178bQ24JP3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam178bQ24JP3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam178bQ24JP3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam178bQ24JP3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam178bQ24JP3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam178bQ24JP3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam178bQ24JP3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam178bQ24JP3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam178bQ24JP3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam178bQ24JP3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam178bQ24JP3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam178bQ24JP3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam178bQ24JP3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam178bQ24JP3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam178bQ24JP3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam178bQ24JP3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
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