Protein–RNA interactions for Protein: Q149G0

UPF0561 protein C2orf68 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q149G0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q149G0 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q149G0 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q149G0 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q149G0 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q149G0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q149G0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q149G0 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q149G0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q149G0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q149G0 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q149G0 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q149G0 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Q149G0 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q149G0 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q149G0 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q149G0 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q149G0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q149G0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q149G0 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q149G0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q149G0 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q149G0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q149G0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q149G0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q149G0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q149G0 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q149G0 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q149G0 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q149G0 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q149G0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q149G0 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q149G0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q149G0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q149G0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q149G0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q149G0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q149G0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q149G0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q149G0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q149G0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q149G0 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Q149G0 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Q149G0 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Q149G0 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q149G0 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q149G0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q149G0 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q149G0 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Q149G0 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q149G0 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Q149G0 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Q149G0 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Q149G0 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Q149G0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q149G0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q149G0 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q149G0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q149G0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q149G0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q149G0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q149G0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q149G0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q149G0 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q149G0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Q149G0 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q149G0 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q149G0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q149G0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q149G0 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q149G0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q149G0 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q149G0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q149G0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q149G0 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q149G0 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q149G0 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q149G0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q149G0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q149G0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q149G0 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q149G0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q149G0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q149G0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q149G0 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q149G0 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q149G0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q149G0 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q149G0 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q149G0 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q149G0 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q149G0 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q149G0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q149G0 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q149G0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q149G0 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q149G0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q149G0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q149G0 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Q149G0 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms