Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spatc1Q148B6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spatc1Q148B6 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spatc1Q148B6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spatc1Q148B6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spatc1Q148B6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spatc1Q148B6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spatc1Q148B6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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Spatc1Q148B6 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spatc1Q148B6 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spatc1Q148B6 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spatc1Q148B6 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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Spatc1Q148B6 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spatc1Q148B6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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Spatc1Q148B6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spatc1Q148B6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spatc1Q148B6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spatc1Q148B6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spatc1Q148B6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spatc1Q148B6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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Spatc1Q148B6 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spatc1Q148B6 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Spatc1Q148B6 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spatc1Q148B6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spatc1Q148B6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spatc1Q148B6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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Spatc1Q148B6 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spatc1Q148B6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spatc1Q148B6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spatc1Q148B6 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Spatc1Q148B6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spatc1Q148B6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Spatc1Q148B6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Spatc1Q148B6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Spatc1Q148B6 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spatc1Q148B6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spatc1Q148B6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spatc1Q148B6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spatc1Q148B6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spatc1Q148B6 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spatc1Q148B6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spatc1Q148B6 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spatc1Q148B6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Spatc1Q148B6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spatc1Q148B6 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spatc1Q148B6 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spatc1Q148B6 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spatc1Q148B6 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms