Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Gli2Q0VGT2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gli2Q0VGT2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
Gli2Q0VGT2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC27.58■■■□□ 2
Gli2Q0VGT2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gli2Q0VGT2 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Gli2Q0VGT2 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gli2Q0VGT2 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Gli2Q0VGT2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gli2Q0VGT2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gli2Q0VGT2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Gli2Q0VGT2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gli2Q0VGT2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gli2Q0VGT2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Gli2Q0VGT2 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Gli2Q0VGT2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Gli2Q0VGT2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Gli2Q0VGT2 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Gli2Q0VGT2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Gli2Q0VGT2 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Gli2Q0VGT2 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Gli2Q0VGT2 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Gli2Q0VGT2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Gli2Q0VGT2 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Gli2Q0VGT2 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Gli2Q0VGT2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Gli2Q0VGT2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Gli2Q0VGT2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Gli2Q0VGT2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Gli2Q0VGT2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Gli2Q0VGT2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Gli2Q0VGT2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Gli2Q0VGT2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Gli2Q0VGT2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Gli2Q0VGT2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Gli2Q0VGT2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Gli2Q0VGT2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Gli2Q0VGT2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Gli2Q0VGT2 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Gli2Q0VGT2 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Gli2Q0VGT2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Gli2Q0VGT2 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Gli2Q0VGT2 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Gli2Q0VGT2 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Gli2Q0VGT2 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Gli2Q0VGT2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Gli2Q0VGT2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Gli2Q0VGT2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Gli2Q0VGT2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Gli2Q0VGT2 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC27.51■■■□□ 2
Gli2Q0VGT2 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC27.51■■■□□ 2
Gli2Q0VGT2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Gli2Q0VGT2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC27.51■■■□□ 2
Gli2Q0VGT2 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Gli2Q0VGT2 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gli2Q0VGT2 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gli2Q0VGT2 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gli2Q0VGT2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gli2Q0VGT2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gli2Q0VGT2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gli2Q0VGT2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gli2Q0VGT2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gli2Q0VGT2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gli2Q0VGT2 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gli2Q0VGT2 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Gli2Q0VGT2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gli2Q0VGT2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gli2Q0VGT2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gli2Q0VGT2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gli2Q0VGT2 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gli2Q0VGT2 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Gli2Q0VGT2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gli2Q0VGT2 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gli2Q0VGT2 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Gli2Q0VGT2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gli2Q0VGT2 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gli2Q0VGT2 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gli2Q0VGT2 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gli2Q0VGT2 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gli2Q0VGT2 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gli2Q0VGT2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gli2Q0VGT2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gli2Q0VGT2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gli2Q0VGT2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gli2Q0VGT2 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gli2Q0VGT2 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gli2Q0VGT2 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gli2Q0VGT2 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gli2Q0VGT2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gli2Q0VGT2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gli2Q0VGT2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Gli2Q0VGT2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gli2Q0VGT2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gli2Q0VGT2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gli2Q0VGT2 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gli2Q0VGT2 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Gli2Q0VGT2 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Gli2Q0VGT2 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gli2Q0VGT2 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Gli2Q0VGT2 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms