Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttc39dQ0VF76 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttc39dQ0VF76 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttc39dQ0VF76 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttc39dQ0VF76 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttc39dQ0VF76 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttc39dQ0VF76 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttc39dQ0VF76 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttc39dQ0VF76 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttc39dQ0VF76 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttc39dQ0VF76 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttc39dQ0VF76 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttc39dQ0VF76 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttc39dQ0VF76 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttc39dQ0VF76 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttc39dQ0VF76 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttc39dQ0VF76 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttc39dQ0VF76 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttc39dQ0VF76 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttc39dQ0VF76 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttc39dQ0VF76 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttc39dQ0VF76 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttc39dQ0VF76 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttc39dQ0VF76 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttc39dQ0VF76 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttc39dQ0VF76 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttc39dQ0VF76 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttc39dQ0VF76 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttc39dQ0VF76 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttc39dQ0VF76 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttc39dQ0VF76 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttc39dQ0VF76 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttc39dQ0VF76 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttc39dQ0VF76 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttc39dQ0VF76 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttc39dQ0VF76 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttc39dQ0VF76 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttc39dQ0VF76 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ttc39dQ0VF76 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ttc39dQ0VF76 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ttc39dQ0VF76 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ttc39dQ0VF76 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ttc39dQ0VF76 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ttc39dQ0VF76 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ttc39dQ0VF76 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ttc39dQ0VF76 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ttc39dQ0VF76 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttc39dQ0VF76 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttc39dQ0VF76 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttc39dQ0VF76 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttc39dQ0VF76 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttc39dQ0VF76 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttc39dQ0VF76 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttc39dQ0VF76 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttc39dQ0VF76 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttc39dQ0VF76 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttc39dQ0VF76 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttc39dQ0VF76 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttc39dQ0VF76 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttc39dQ0VF76 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttc39dQ0VF76 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttc39dQ0VF76 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttc39dQ0VF76 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttc39dQ0VF76 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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Ttc39dQ0VF76 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttc39dQ0VF76 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttc39dQ0VF76 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttc39dQ0VF76 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
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Ttc39dQ0VF76 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttc39dQ0VF76 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttc39dQ0VF76 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttc39dQ0VF76 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttc39dQ0VF76 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttc39dQ0VF76 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttc39dQ0VF76 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttc39dQ0VF76 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttc39dQ0VF76 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttc39dQ0VF76 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttc39dQ0VF76 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttc39dQ0VF76 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttc39dQ0VF76 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttc39dQ0VF76 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttc39dQ0VF76 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttc39dQ0VF76 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttc39dQ0VF76 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttc39dQ0VF76 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttc39dQ0VF76 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttc39dQ0VF76 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttc39dQ0VF76 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttc39dQ0VF76 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttc39dQ0VF76 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttc39dQ0VF76 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttc39dQ0VF76 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttc39dQ0VF76 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttc39dQ0VF76 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttc39dQ0VF76 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttc39dQ0VF76 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttc39dQ0VF76 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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