Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T7

Cntnap5c, Contactin-associated protein like 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5cQ0V8T7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cntnap5cQ0V8T7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cntnap5cQ0V8T7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cntnap5cQ0V8T7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cntnap5cQ0V8T7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cntnap5cQ0V8T7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cntnap5cQ0V8T7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cntnap5cQ0V8T7 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cntnap5cQ0V8T7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cntnap5cQ0V8T7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cntnap5cQ0V8T7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cntnap5cQ0V8T7 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cntnap5cQ0V8T7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cntnap5cQ0V8T7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cntnap5cQ0V8T7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cntnap5cQ0V8T7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Cntnap5cQ0V8T7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cntnap5cQ0V8T7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cntnap5cQ0V8T7 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cntnap5cQ0V8T7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cntnap5cQ0V8T7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cntnap5cQ0V8T7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cntnap5cQ0V8T7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cntnap5cQ0V8T7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cntnap5cQ0V8T7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cntnap5cQ0V8T7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cntnap5cQ0V8T7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cntnap5cQ0V8T7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cntnap5cQ0V8T7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Cntnap5cQ0V8T7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Cntnap5cQ0V8T7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cntnap5cQ0V8T7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cntnap5cQ0V8T7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cntnap5cQ0V8T7 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cntnap5cQ0V8T7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cntnap5cQ0V8T7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cntnap5cQ0V8T7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cntnap5cQ0V8T7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cntnap5cQ0V8T7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cntnap5cQ0V8T7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cntnap5cQ0V8T7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cntnap5cQ0V8T7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cntnap5cQ0V8T7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cntnap5cQ0V8T7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cntnap5cQ0V8T7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cntnap5cQ0V8T7 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cntnap5cQ0V8T7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cntnap5cQ0V8T7 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cntnap5cQ0V8T7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cntnap5cQ0V8T7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cntnap5cQ0V8T7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cntnap5cQ0V8T7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cntnap5cQ0V8T7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cntnap5cQ0V8T7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cntnap5cQ0V8T7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cntnap5cQ0V8T7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cntnap5cQ0V8T7 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cntnap5cQ0V8T7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cntnap5cQ0V8T7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cntnap5cQ0V8T7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cntnap5cQ0V8T7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cntnap5cQ0V8T7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cntnap5cQ0V8T7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cntnap5cQ0V8T7 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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Cntnap5cQ0V8T7 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cntnap5cQ0V8T7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cntnap5cQ0V8T7 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cntnap5cQ0V8T7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cntnap5cQ0V8T7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cntnap5cQ0V8T7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cntnap5cQ0V8T7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cntnap5cQ0V8T7 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cntnap5cQ0V8T7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cntnap5cQ0V8T7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cntnap5cQ0V8T7 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Cntnap5cQ0V8T7 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cntnap5cQ0V8T7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cntnap5cQ0V8T7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cntnap5cQ0V8T7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cntnap5cQ0V8T7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cntnap5cQ0V8T7 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Cntnap5cQ0V8T7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cntnap5cQ0V8T7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cntnap5cQ0V8T7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cntnap5cQ0V8T7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cntnap5cQ0V8T7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cntnap5cQ0V8T7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cntnap5cQ0V8T7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cntnap5cQ0V8T7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cntnap5cQ0V8T7 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Cntnap5cQ0V8T7 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cntnap5cQ0V8T7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cntnap5cQ0V8T7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cntnap5cQ0V8T7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cntnap5cQ0V8T7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cntnap5cQ0V8T7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cntnap5cQ0V8T7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cntnap5cQ0V8T7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms