Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab42Q0PD08 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab42Q0PD08 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab42Q0PD08 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab42Q0PD08 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab42Q0PD08 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab42Q0PD08 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab42Q0PD08 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab42Q0PD08 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab42Q0PD08 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab42Q0PD08 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rab42Q0PD08 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Rab42Q0PD08 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rab42Q0PD08 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rab42Q0PD08 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rab42Q0PD08 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rab42Q0PD08 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab42Q0PD08 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab42Q0PD08 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab42Q0PD08 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab42Q0PD08 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab42Q0PD08 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab42Q0PD08 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab42Q0PD08 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab42Q0PD08 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab42Q0PD08 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab42Q0PD08 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab42Q0PD08 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab42Q0PD08 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab42Q0PD08 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab42Q0PD08 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab42Q0PD08 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab42Q0PD08 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab42Q0PD08 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab42Q0PD08 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab42Q0PD08 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab42Q0PD08 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab42Q0PD08 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab42Q0PD08 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab42Q0PD08 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab42Q0PD08 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab42Q0PD08 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab42Q0PD08 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab42Q0PD08 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab42Q0PD08 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab42Q0PD08 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab42Q0PD08 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab42Q0PD08 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab42Q0PD08 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab42Q0PD08 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab42Q0PD08 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab42Q0PD08 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab42Q0PD08 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab42Q0PD08 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab42Q0PD08 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab42Q0PD08 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab42Q0PD08 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab42Q0PD08 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab42Q0PD08 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab42Q0PD08 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab42Q0PD08 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab42Q0PD08 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab42Q0PD08 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab42Q0PD08 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab42Q0PD08 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab42Q0PD08 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab42Q0PD08 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab42Q0PD08 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab42Q0PD08 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab42Q0PD08 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab42Q0PD08 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab42Q0PD08 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab42Q0PD08 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab42Q0PD08 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab42Q0PD08 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab42Q0PD08 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab42Q0PD08 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab42Q0PD08 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab42Q0PD08 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab42Q0PD08 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab42Q0PD08 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab42Q0PD08 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab42Q0PD08 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab42Q0PD08 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab42Q0PD08 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab42Q0PD08 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab42Q0PD08 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab42Q0PD08 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab42Q0PD08 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab42Q0PD08 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rab42Q0PD08 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rab42Q0PD08 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rab42Q0PD08 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rab42Q0PD08 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rab42Q0PD08 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab42Q0PD08 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab42Q0PD08 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab42Q0PD08 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab42Q0PD08 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab42Q0PD08 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms