Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Spata18Q0P557 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Spata18Q0P557 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Spata18Q0P557 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Spata18Q0P557 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Spata18Q0P557 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Spata18Q0P557 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Spata18Q0P557 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Spata18Q0P557 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Spata18Q0P557 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Spata18Q0P557 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Spata18Q0P557 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Spata18Q0P557 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Spata18Q0P557 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Spata18Q0P557 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Spata18Q0P557 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Spata18Q0P557 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Spata18Q0P557 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Spata18Q0P557 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Spata18Q0P557 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Spata18Q0P557 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Spata18Q0P557 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Spata18Q0P557 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Spata18Q0P557 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Spata18Q0P557 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Spata18Q0P557 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Spata18Q0P557 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Spata18Q0P557 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Spata18Q0P557 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Spata18Q0P557 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Spata18Q0P557 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Spata18Q0P557 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Spata18Q0P557 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Spata18Q0P557 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Spata18Q0P557 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Spata18Q0P557 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Spata18Q0P557 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Spata18Q0P557 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Spata18Q0P557 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Spata18Q0P557 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Spata18Q0P557 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Spata18Q0P557 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Spata18Q0P557 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Spata18Q0P557 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Spata18Q0P557 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Spata18Q0P557 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Spata18Q0P557 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Spata18Q0P557 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Spata18Q0P557 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Spata18Q0P557 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Spata18Q0P557 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Spata18Q0P557 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Spata18Q0P557 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Spata18Q0P557 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Spata18Q0P557 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Spata18Q0P557 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Spata18Q0P557 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Spata18Q0P557 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Spata18Q0P557 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Spata18Q0P557 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Spata18Q0P557 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Spata18Q0P557 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Spata18Q0P557 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Spata18Q0P557 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Spata18Q0P557 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Spata18Q0P557 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Spata18Q0P557 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Spata18Q0P557 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Spata18Q0P557 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Spata18Q0P557 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Spata18Q0P557 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Spata18Q0P557 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Spata18Q0P557 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Spata18Q0P557 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Spata18Q0P557 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Spata18Q0P557 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Spata18Q0P557 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Spata18Q0P557 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Spata18Q0P557 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Spata18Q0P557 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Spata18Q0P557 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Spata18Q0P557 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Spata18Q0P557 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Spata18Q0P557 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Spata18Q0P557 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Spata18Q0P557 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Spata18Q0P557 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Spata18Q0P557 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Spata18Q0P557 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Spata18Q0P557 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Spata18Q0P557 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spata18Q0P557 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spata18Q0P557 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spata18Q0P557 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spata18Q0P557 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spata18Q0P557 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spata18Q0P557 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spata18Q0P557 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spata18Q0P557 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spata18Q0P557 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms