Protein–RNA interactions for Protein: Q0MW30

Neurl1b, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, mousemouse

Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1bQ0MW30 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Neurl1bQ0MW30 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Neurl1bQ0MW30 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Neurl1bQ0MW30 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Neurl1bQ0MW30 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Neurl1bQ0MW30 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Neurl1bQ0MW30 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Neurl1bQ0MW30 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Neurl1bQ0MW30 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Neurl1bQ0MW30 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Neurl1bQ0MW30 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Neurl1bQ0MW30 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Neurl1bQ0MW30 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Neurl1bQ0MW30 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Neurl1bQ0MW30 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Neurl1bQ0MW30 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Neurl1bQ0MW30 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Neurl1bQ0MW30 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Neurl1bQ0MW30 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Neurl1bQ0MW30 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Neurl1bQ0MW30 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Neurl1bQ0MW30 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Neurl1bQ0MW30 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Neurl1bQ0MW30 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Neurl1bQ0MW30 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Neurl1bQ0MW30 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Neurl1bQ0MW30 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Neurl1bQ0MW30 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Neurl1bQ0MW30 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Neurl1bQ0MW30 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Neurl1bQ0MW30 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Neurl1bQ0MW30 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Neurl1bQ0MW30 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Neurl1bQ0MW30 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Neurl1bQ0MW30 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Neurl1bQ0MW30 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Neurl1bQ0MW30 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Neurl1bQ0MW30 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Neurl1bQ0MW30 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Neurl1bQ0MW30 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Neurl1bQ0MW30 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Neurl1bQ0MW30 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Neurl1bQ0MW30 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Neurl1bQ0MW30 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Neurl1bQ0MW30 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Neurl1bQ0MW30 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Neurl1bQ0MW30 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Neurl1bQ0MW30 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Neurl1bQ0MW30 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Neurl1bQ0MW30 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Neurl1bQ0MW30 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Neurl1bQ0MW30 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Neurl1bQ0MW30 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Neurl1bQ0MW30 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Neurl1bQ0MW30 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Neurl1bQ0MW30 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Neurl1bQ0MW30 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Neurl1bQ0MW30 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Neurl1bQ0MW30 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Neurl1bQ0MW30 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Neurl1bQ0MW30 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Neurl1bQ0MW30 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Neurl1bQ0MW30 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Neurl1bQ0MW30 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Neurl1bQ0MW30 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Neurl1bQ0MW30 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Neurl1bQ0MW30 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Neurl1bQ0MW30 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Neurl1bQ0MW30 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Neurl1bQ0MW30 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Neurl1bQ0MW30 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Neurl1bQ0MW30 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Neurl1bQ0MW30 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Neurl1bQ0MW30 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Neurl1bQ0MW30 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Neurl1bQ0MW30 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Neurl1bQ0MW30 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Neurl1bQ0MW30 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Neurl1bQ0MW30 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Neurl1bQ0MW30 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Neurl1bQ0MW30 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Neurl1bQ0MW30 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Neurl1bQ0MW30 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Neurl1bQ0MW30 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Neurl1bQ0MW30 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Neurl1bQ0MW30 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Neurl1bQ0MW30 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Neurl1bQ0MW30 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Neurl1bQ0MW30 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Neurl1bQ0MW30 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Neurl1bQ0MW30 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Neurl1bQ0MW30 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Neurl1bQ0MW30 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Neurl1bQ0MW30 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Neurl1bQ0MW30 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Neurl1bQ0MW30 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Neurl1bQ0MW30 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Neurl1bQ0MW30 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Neurl1bQ0MW30 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Neurl1bQ0MW30 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms