Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
1700061G19RikQ08EE8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
1700061G19RikQ08EE8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
1700061G19RikQ08EE8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
1700061G19RikQ08EE8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
1700061G19RikQ08EE8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
1700061G19RikQ08EE8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
1700061G19RikQ08EE8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
1700061G19RikQ08EE8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
1700061G19RikQ08EE8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
1700061G19RikQ08EE8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
1700061G19RikQ08EE8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
1700061G19RikQ08EE8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
1700061G19RikQ08EE8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
1700061G19RikQ08EE8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
1700061G19RikQ08EE8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
1700061G19RikQ08EE8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
1700061G19RikQ08EE8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
1700061G19RikQ08EE8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
1700061G19RikQ08EE8 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
1700061G19RikQ08EE8 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
1700061G19RikQ08EE8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
1700061G19RikQ08EE8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
1700061G19RikQ08EE8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
1700061G19RikQ08EE8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
1700061G19RikQ08EE8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
1700061G19RikQ08EE8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
1700061G19RikQ08EE8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
1700061G19RikQ08EE8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
1700061G19RikQ08EE8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
1700061G19RikQ08EE8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
1700061G19RikQ08EE8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
1700061G19RikQ08EE8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
1700061G19RikQ08EE8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
1700061G19RikQ08EE8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
1700061G19RikQ08EE8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
1700061G19RikQ08EE8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
1700061G19RikQ08EE8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
1700061G19RikQ08EE8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
1700061G19RikQ08EE8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
1700061G19RikQ08EE8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
1700061G19RikQ08EE8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
1700061G19RikQ08EE8 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
1700061G19RikQ08EE8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
1700061G19RikQ08EE8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
1700061G19RikQ08EE8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
1700061G19RikQ08EE8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
1700061G19RikQ08EE8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
1700061G19RikQ08EE8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
1700061G19RikQ08EE8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
1700061G19RikQ08EE8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
1700061G19RikQ08EE8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
1700061G19RikQ08EE8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
1700061G19RikQ08EE8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
1700061G19RikQ08EE8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
1700061G19RikQ08EE8 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
1700061G19RikQ08EE8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
1700061G19RikQ08EE8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
1700061G19RikQ08EE8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
1700061G19RikQ08EE8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
1700061G19RikQ08EE8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
1700061G19RikQ08EE8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
1700061G19RikQ08EE8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
1700061G19RikQ08EE8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
1700061G19RikQ08EE8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
1700061G19RikQ08EE8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
1700061G19RikQ08EE8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
1700061G19RikQ08EE8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
1700061G19RikQ08EE8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
1700061G19RikQ08EE8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
1700061G19RikQ08EE8 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
1700061G19RikQ08EE8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
1700061G19RikQ08EE8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
1700061G19RikQ08EE8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
1700061G19RikQ08EE8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
1700061G19RikQ08EE8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
1700061G19RikQ08EE8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
1700061G19RikQ08EE8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
1700061G19RikQ08EE8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
1700061G19RikQ08EE8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
1700061G19RikQ08EE8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
1700061G19RikQ08EE8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
1700061G19RikQ08EE8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
1700061G19RikQ08EE8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
1700061G19RikQ08EE8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
1700061G19RikQ08EE8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
1700061G19RikQ08EE8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
1700061G19RikQ08EE8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
1700061G19RikQ08EE8 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
1700061G19RikQ08EE8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
1700061G19RikQ08EE8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
1700061G19RikQ08EE8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
1700061G19RikQ08EE8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
1700061G19RikQ08EE8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
1700061G19RikQ08EE8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
1700061G19RikQ08EE8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
1700061G19RikQ08EE8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
1700061G19RikQ08EE8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
1700061G19RikQ08EE8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
1700061G19RikQ08EE8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms