Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kcnma1Q08460 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kcnma1Q08460 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kcnma1Q08460 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kcnma1Q08460 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kcnma1Q08460 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kcnma1Q08460 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kcnma1Q08460 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kcnma1Q08460 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kcnma1Q08460 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kcnma1Q08460 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kcnma1Q08460 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kcnma1Q08460 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Kcnma1Q08460 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kcnma1Q08460 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kcnma1Q08460 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kcnma1Q08460 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kcnma1Q08460 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kcnma1Q08460 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kcnma1Q08460 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kcnma1Q08460 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kcnma1Q08460 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kcnma1Q08460 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kcnma1Q08460 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kcnma1Q08460 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kcnma1Q08460 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Kcnma1Q08460 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Kcnma1Q08460 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Kcnma1Q08460 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Kcnma1Q08460 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Kcnma1Q08460 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Kcnma1Q08460 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Kcnma1Q08460 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Kcnma1Q08460 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Kcnma1Q08460 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Kcnma1Q08460 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kcnma1Q08460 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kcnma1Q08460 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kcnma1Q08460 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kcnma1Q08460 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kcnma1Q08460 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kcnma1Q08460 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kcnma1Q08460 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kcnma1Q08460 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kcnma1Q08460 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kcnma1Q08460 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kcnma1Q08460 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kcnma1Q08460 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kcnma1Q08460 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kcnma1Q08460 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kcnma1Q08460 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kcnma1Q08460 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kcnma1Q08460 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kcnma1Q08460 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kcnma1Q08460 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kcnma1Q08460 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kcnma1Q08460 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Kcnma1Q08460 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Kcnma1Q08460 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Kcnma1Q08460 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Kcnma1Q08460 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Kcnma1Q08460 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Kcnma1Q08460 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Kcnma1Q08460 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Kcnma1Q08460 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kcnma1Q08460 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kcnma1Q08460 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kcnma1Q08460 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kcnma1Q08460 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kcnma1Q08460 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kcnma1Q08460 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kcnma1Q08460 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kcnma1Q08460 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kcnma1Q08460 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kcnma1Q08460 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kcnma1Q08460 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kcnma1Q08460 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kcnma1Q08460 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kcnma1Q08460 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kcnma1Q08460 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kcnma1Q08460 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kcnma1Q08460 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Kcnma1Q08460 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Kcnma1Q08460 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Kcnma1Q08460 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Kcnma1Q08460 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Kcnma1Q08460 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Kcnma1Q08460 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Kcnma1Q08460 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Kcnma1Q08460 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Kcnma1Q08460 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Kcnma1Q08460 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Kcnma1Q08460 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Kcnma1Q08460 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Kcnma1Q08460 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Kcnma1Q08460 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Kcnma1Q08460 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Kcnma1Q08460 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Kcnma1Q08460 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Kcnma1Q08460 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms