Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Cnn2Q08093 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cnn2Q08093 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cnn2Q08093 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cnn2Q08093 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cnn2Q08093 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cnn2Q08093 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Cnn2Q08093 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cnn2Q08093 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cnn2Q08093 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Cnn2Q08093 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cnn2Q08093 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cnn2Q08093 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnn2Q08093 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnn2Q08093 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnn2Q08093 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnn2Q08093 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnn2Q08093 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnn2Q08093 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnn2Q08093 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnn2Q08093 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnn2Q08093 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnn2Q08093 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnn2Q08093 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnn2Q08093 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnn2Q08093 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnn2Q08093 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnn2Q08093 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnn2Q08093 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnn2Q08093 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnn2Q08093 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnn2Q08093 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnn2Q08093 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnn2Q08093 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnn2Q08093 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnn2Q08093 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnn2Q08093 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnn2Q08093 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnn2Q08093 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnn2Q08093 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnn2Q08093 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnn2Q08093 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnn2Q08093 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnn2Q08093 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnn2Q08093 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnn2Q08093 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnn2Q08093 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnn2Q08093 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnn2Q08093 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cnn2Q08093 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cnn2Q08093 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cnn2Q08093 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cnn2Q08093 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cnn2Q08093 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cnn2Q08093 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cnn2Q08093 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cnn2Q08093 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnn2Q08093 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnn2Q08093 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnn2Q08093 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnn2Q08093 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnn2Q08093 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnn2Q08093 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnn2Q08093 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnn2Q08093 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnn2Q08093 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnn2Q08093 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnn2Q08093 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnn2Q08093 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnn2Q08093 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnn2Q08093 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnn2Q08093 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnn2Q08093 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnn2Q08093 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnn2Q08093 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnn2Q08093 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Cnn2Q08093 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnn2Q08093 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cnn2Q08093 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnn2Q08093 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnn2Q08093 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnn2Q08093 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnn2Q08093 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cnn2Q08093 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnn2Q08093 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnn2Q08093 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnn2Q08093 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnn2Q08093 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnn2Q08093 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnn2Q08093 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnn2Q08093 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnn2Q08093 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnn2Q08093 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnn2Q08093 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnn2Q08093 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnn2Q08093 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnn2Q08093 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnn2Q08093 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnn2Q08093 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnn2Q08093 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms