Protein–RNA interactions for Protein: Q06507

Atf4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf4Q06507 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atf4Q06507 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atf4Q06507 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atf4Q06507 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atf4Q06507 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atf4Q06507 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atf4Q06507 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atf4Q06507 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atf4Q06507 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atf4Q06507 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atf4Q06507 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atf4Q06507 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atf4Q06507 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Atf4Q06507 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atf4Q06507 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atf4Q06507 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atf4Q06507 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atf4Q06507 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atf4Q06507 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atf4Q06507 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atf4Q06507 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atf4Q06507 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Atf4Q06507 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Atf4Q06507 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Atf4Q06507 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atf4Q06507 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atf4Q06507 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atf4Q06507 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atf4Q06507 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atf4Q06507 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atf4Q06507 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atf4Q06507 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atf4Q06507 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atf4Q06507 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atf4Q06507 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atf4Q06507 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atf4Q06507 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atf4Q06507 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atf4Q06507 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atf4Q06507 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atf4Q06507 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atf4Q06507 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atf4Q06507 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atf4Q06507 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atf4Q06507 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atf4Q06507 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atf4Q06507 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atf4Q06507 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atf4Q06507 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atf4Q06507 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atf4Q06507 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atf4Q06507 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atf4Q06507 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atf4Q06507 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atf4Q06507 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atf4Q06507 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atf4Q06507 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atf4Q06507 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atf4Q06507 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atf4Q06507 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atf4Q06507 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atf4Q06507 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atf4Q06507 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atf4Q06507 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atf4Q06507 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Atf4Q06507 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atf4Q06507 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atf4Q06507 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atf4Q06507 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atf4Q06507 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atf4Q06507 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atf4Q06507 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atf4Q06507 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Atf4Q06507 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atf4Q06507 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atf4Q06507 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atf4Q06507 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atf4Q06507 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atf4Q06507 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atf4Q06507 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atf4Q06507 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atf4Q06507 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atf4Q06507 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atf4Q06507 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atf4Q06507 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atf4Q06507 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atf4Q06507 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atf4Q06507 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Atf4Q06507 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atf4Q06507 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atf4Q06507 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atf4Q06507 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atf4Q06507 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atf4Q06507 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Atf4Q06507 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atf4Q06507 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Atf4Q06507 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Atf4Q06507 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Atf4Q06507 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atf4Q06507 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms