Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prrx2Q06348 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prrx2Q06348 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prrx2Q06348 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prrx2Q06348 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prrx2Q06348 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prrx2Q06348 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prrx2Q06348 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prrx2Q06348 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prrx2Q06348 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prrx2Q06348 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prrx2Q06348 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prrx2Q06348 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prrx2Q06348 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prrx2Q06348 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Prrx2Q06348 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prrx2Q06348 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prrx2Q06348 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prrx2Q06348 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prrx2Q06348 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prrx2Q06348 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Prrx2Q06348 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prrx2Q06348 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prrx2Q06348 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prrx2Q06348 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prrx2Q06348 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prrx2Q06348 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prrx2Q06348 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prrx2Q06348 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prrx2Q06348 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prrx2Q06348 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prrx2Q06348 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prrx2Q06348 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prrx2Q06348 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Prrx2Q06348 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prrx2Q06348 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prrx2Q06348 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prrx2Q06348 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prrx2Q06348 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prrx2Q06348 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prrx2Q06348 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prrx2Q06348 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prrx2Q06348 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prrx2Q06348 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prrx2Q06348 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prrx2Q06348 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prrx2Q06348 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prrx2Q06348 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prrx2Q06348 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prrx2Q06348 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prrx2Q06348 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prrx2Q06348 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prrx2Q06348 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prrx2Q06348 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Prrx2Q06348 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prrx2Q06348 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prrx2Q06348 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prrx2Q06348 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prrx2Q06348 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prrx2Q06348 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prrx2Q06348 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrx2Q06348 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrx2Q06348 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrx2Q06348 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrx2Q06348 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrx2Q06348 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrx2Q06348 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrx2Q06348 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrx2Q06348 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrx2Q06348 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrx2Q06348 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrx2Q06348 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrx2Q06348 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrx2Q06348 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrx2Q06348 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrx2Q06348 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrx2Q06348 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrx2Q06348 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrx2Q06348 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrx2Q06348 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrx2Q06348 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrx2Q06348 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrx2Q06348 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrx2Q06348 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrx2Q06348 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrx2Q06348 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrx2Q06348 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrx2Q06348 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrx2Q06348 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrx2Q06348 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrx2Q06348 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrx2Q06348 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrx2Q06348 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrx2Q06348 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrx2Q06348 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrx2Q06348 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrx2Q06348 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrx2Q06348 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrx2Q06348 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrx2Q06348 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms