Protein–RNA interactions for Protein: Q05CL8

Larp7, La-related protein 7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Larp7Q05CL8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Larp7Q05CL8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Larp7Q05CL8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Larp7Q05CL8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Larp7Q05CL8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Larp7Q05CL8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Larp7Q05CL8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Larp7Q05CL8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Larp7Q05CL8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Larp7Q05CL8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Larp7Q05CL8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Larp7Q05CL8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Larp7Q05CL8 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Larp7Q05CL8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Larp7Q05CL8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Larp7Q05CL8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Larp7Q05CL8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Larp7Q05CL8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Larp7Q05CL8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Larp7Q05CL8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Larp7Q05CL8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Larp7Q05CL8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Larp7Q05CL8 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Larp7Q05CL8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Larp7Q05CL8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Larp7Q05CL8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Larp7Q05CL8 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Larp7Q05CL8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Larp7Q05CL8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Larp7Q05CL8 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Larp7Q05CL8 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Larp7Q05CL8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Larp7Q05CL8 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Larp7Q05CL8 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Larp7Q05CL8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Larp7Q05CL8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Larp7Q05CL8 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Larp7Q05CL8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Larp7Q05CL8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Larp7Q05CL8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Larp7Q05CL8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Larp7Q05CL8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Larp7Q05CL8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Larp7Q05CL8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Larp7Q05CL8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Larp7Q05CL8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Larp7Q05CL8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Larp7Q05CL8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Larp7Q05CL8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Larp7Q05CL8 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Larp7Q05CL8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Larp7Q05CL8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Larp7Q05CL8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Larp7Q05CL8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Larp7Q05CL8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Larp7Q05CL8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Larp7Q05CL8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Larp7Q05CL8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Larp7Q05CL8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Larp7Q05CL8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Larp7Q05CL8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Larp7Q05CL8 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Larp7Q05CL8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Larp7Q05CL8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Larp7Q05CL8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Larp7Q05CL8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Larp7Q05CL8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Larp7Q05CL8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Larp7Q05CL8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Larp7Q05CL8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Larp7Q05CL8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Larp7Q05CL8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Larp7Q05CL8 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Larp7Q05CL8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Larp7Q05CL8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Larp7Q05CL8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Larp7Q05CL8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Larp7Q05CL8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Larp7Q05CL8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Larp7Q05CL8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Larp7Q05CL8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Larp7Q05CL8 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Larp7Q05CL8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Larp7Q05CL8 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Larp7Q05CL8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Larp7Q05CL8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Larp7Q05CL8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Larp7Q05CL8 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Larp7Q05CL8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Larp7Q05CL8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Larp7Q05CL8 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Larp7Q05CL8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Larp7Q05CL8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Larp7Q05CL8 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Larp7Q05CL8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Larp7Q05CL8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Larp7Q05CL8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Larp7Q05CL8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Larp7Q05CL8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Larp7Q05CL8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms