Protein–RNA interactions for Protein: Q05AH6

SPINDOC, SPIN1-docking protein, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINDOCQ05AH6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPINDOCQ05AH6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPINDOCQ05AH6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPINDOCQ05AH6 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPINDOCQ05AH6 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPINDOCQ05AH6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPINDOCQ05AH6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPINDOCQ05AH6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SPINDOCQ05AH6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPINDOCQ05AH6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPINDOCQ05AH6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPINDOCQ05AH6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPINDOCQ05AH6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPINDOCQ05AH6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPINDOCQ05AH6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPINDOCQ05AH6 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPINDOCQ05AH6 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPINDOCQ05AH6 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPINDOCQ05AH6 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPINDOCQ05AH6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPINDOCQ05AH6 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPINDOCQ05AH6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPINDOCQ05AH6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPINDOCQ05AH6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPINDOCQ05AH6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPINDOCQ05AH6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPINDOCQ05AH6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPINDOCQ05AH6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPINDOCQ05AH6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPINDOCQ05AH6 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPINDOCQ05AH6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPINDOCQ05AH6 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPINDOCQ05AH6 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SPINDOCQ05AH6 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SPINDOCQ05AH6 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPINDOCQ05AH6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPINDOCQ05AH6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPINDOCQ05AH6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPINDOCQ05AH6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPINDOCQ05AH6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPINDOCQ05AH6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPINDOCQ05AH6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPINDOCQ05AH6 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPINDOCQ05AH6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPINDOCQ05AH6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPINDOCQ05AH6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SPINDOCQ05AH6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SPINDOCQ05AH6 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SPINDOCQ05AH6 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SPINDOCQ05AH6 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SPINDOCQ05AH6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SPINDOCQ05AH6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SPINDOCQ05AH6 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SPINDOCQ05AH6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SPINDOCQ05AH6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SPINDOCQ05AH6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SPINDOCQ05AH6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPINDOCQ05AH6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPINDOCQ05AH6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPINDOCQ05AH6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPINDOCQ05AH6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPINDOCQ05AH6 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPINDOCQ05AH6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SPINDOCQ05AH6 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPINDOCQ05AH6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPINDOCQ05AH6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPINDOCQ05AH6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPINDOCQ05AH6 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPINDOCQ05AH6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPINDOCQ05AH6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPINDOCQ05AH6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPINDOCQ05AH6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPINDOCQ05AH6 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPINDOCQ05AH6 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPINDOCQ05AH6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPINDOCQ05AH6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPINDOCQ05AH6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPINDOCQ05AH6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPINDOCQ05AH6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPINDOCQ05AH6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPINDOCQ05AH6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPINDOCQ05AH6 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPINDOCQ05AH6 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPINDOCQ05AH6 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPINDOCQ05AH6 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPINDOCQ05AH6 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPINDOCQ05AH6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPINDOCQ05AH6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPINDOCQ05AH6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPINDOCQ05AH6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPINDOCQ05AH6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPINDOCQ05AH6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPINDOCQ05AH6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPINDOCQ05AH6 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPINDOCQ05AH6 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPINDOCQ05AH6 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPINDOCQ05AH6 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPINDOCQ05AH6 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPINDOCQ05AH6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPINDOCQ05AH6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms