Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Thbs3Q05895 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Thbs3Q05895 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Thbs3Q05895 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Thbs3Q05895 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Thbs3Q05895 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Thbs3Q05895 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Thbs3Q05895 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Thbs3Q05895 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Thbs3Q05895 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Thbs3Q05895 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Thbs3Q05895 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Thbs3Q05895 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Thbs3Q05895 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Thbs3Q05895 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Thbs3Q05895 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Thbs3Q05895 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Thbs3Q05895 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Thbs3Q05895 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Thbs3Q05895 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Thbs3Q05895 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Thbs3Q05895 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Thbs3Q05895 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Thbs3Q05895 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Thbs3Q05895 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Thbs3Q05895 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Thbs3Q05895 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Thbs3Q05895 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Thbs3Q05895 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Thbs3Q05895 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Thbs3Q05895 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Thbs3Q05895 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Thbs3Q05895 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Thbs3Q05895 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Thbs3Q05895 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Thbs3Q05895 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Thbs3Q05895 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Thbs3Q05895 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Thbs3Q05895 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Thbs3Q05895 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Thbs3Q05895 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Thbs3Q05895 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Thbs3Q05895 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Thbs3Q05895 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Thbs3Q05895 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Thbs3Q05895 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Thbs3Q05895 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Thbs3Q05895 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Thbs3Q05895 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Thbs3Q05895 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Thbs3Q05895 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Thbs3Q05895 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Thbs3Q05895 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Thbs3Q05895 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Thbs3Q05895 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Thbs3Q05895 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Thbs3Q05895 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Thbs3Q05895 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Thbs3Q05895 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Thbs3Q05895 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Thbs3Q05895 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Thbs3Q05895 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Thbs3Q05895 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Thbs3Q05895 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Thbs3Q05895 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Thbs3Q05895 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Thbs3Q05895 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Thbs3Q05895 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Thbs3Q05895 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Thbs3Q05895 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Thbs3Q05895 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Thbs3Q05895 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Thbs3Q05895 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Thbs3Q05895 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Thbs3Q05895 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Thbs3Q05895 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Thbs3Q05895 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Thbs3Q05895 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Thbs3Q05895 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Thbs3Q05895 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Thbs3Q05895 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Thbs3Q05895 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Thbs3Q05895 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Thbs3Q05895 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Thbs3Q05895 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Thbs3Q05895 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Thbs3Q05895 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Thbs3Q05895 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Thbs3Q05895 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Thbs3Q05895 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Thbs3Q05895 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Thbs3Q05895 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Thbs3Q05895 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Thbs3Q05895 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Thbs3Q05895 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
Thbs3Q05895 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Thbs3Q05895 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Thbs3Q05895 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Thbs3Q05895 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Thbs3Q05895 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms