Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apoc2Q05020 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apoc2Q05020 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apoc2Q05020 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apoc2Q05020 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apoc2Q05020 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apoc2Q05020 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apoc2Q05020 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apoc2Q05020 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Apoc2Q05020 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Apoc2Q05020 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apoc2Q05020 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apoc2Q05020 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apoc2Q05020 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apoc2Q05020 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apoc2Q05020 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apoc2Q05020 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apoc2Q05020 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apoc2Q05020 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apoc2Q05020 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apoc2Q05020 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apoc2Q05020 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apoc2Q05020 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apoc2Q05020 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apoc2Q05020 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apoc2Q05020 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apoc2Q05020 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apoc2Q05020 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apoc2Q05020 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apoc2Q05020 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apoc2Q05020 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apoc2Q05020 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apoc2Q05020 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apoc2Q05020 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apoc2Q05020 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apoc2Q05020 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apoc2Q05020 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apoc2Q05020 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apoc2Q05020 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apoc2Q05020 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apoc2Q05020 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apoc2Q05020 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Apoc2Q05020 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apoc2Q05020 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apoc2Q05020 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apoc2Q05020 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apoc2Q05020 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apoc2Q05020 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apoc2Q05020 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apoc2Q05020 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Apoc2Q05020 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apoc2Q05020 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apoc2Q05020 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apoc2Q05020 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apoc2Q05020 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apoc2Q05020 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apoc2Q05020 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apoc2Q05020 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apoc2Q05020 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Apoc2Q05020 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Apoc2Q05020 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Apoc2Q05020 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Apoc2Q05020 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Apoc2Q05020 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Apoc2Q05020 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Apoc2Q05020 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Apoc2Q05020 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Apoc2Q05020 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Apoc2Q05020 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Apoc2Q05020 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Apoc2Q05020 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Apoc2Q05020 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Apoc2Q05020 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Apoc2Q05020 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Apoc2Q05020 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Apoc2Q05020 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Apoc2Q05020 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Apoc2Q05020 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Apoc2Q05020 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Apoc2Q05020 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Apoc2Q05020 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Apoc2Q05020 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Apoc2Q05020 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Apoc2Q05020 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Apoc2Q05020 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Apoc2Q05020 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Apoc2Q05020 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Apoc2Q05020 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Apoc2Q05020 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Apoc2Q05020 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Apoc2Q05020 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Apoc2Q05020 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Apoc2Q05020 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apoc2Q05020 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apoc2Q05020 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apoc2Q05020 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apoc2Q05020 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apoc2Q05020 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apoc2Q05020 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apoc2Q05020 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms