Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sox12Q04890 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Sox12Q04890 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sox12Q04890 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sox12Q04890 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sox12Q04890 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sox12Q04890 Il4-204ENSMUST00000150568 605 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sox12Q04890 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sox12Q04890 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sox12Q04890 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sox12Q04890 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sox12Q04890 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sox12Q04890 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sox12Q04890 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sox12Q04890 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sox12Q04890 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sox12Q04890 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sox12Q04890 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sox12Q04890 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sox12Q04890 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sox12Q04890 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sox12Q04890 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sox12Q04890 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sox12Q04890 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sox12Q04890 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sox12Q04890 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sox12Q04890 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sox12Q04890 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sox12Q04890 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sox12Q04890 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sox12Q04890 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sox12Q04890 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sox12Q04890 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sox12Q04890 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Sox12Q04890 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sox12Q04890 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sox12Q04890 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sox12Q04890 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sox12Q04890 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sox12Q04890 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sox12Q04890 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sox12Q04890 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sox12Q04890 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sox12Q04890 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Sox12Q04890 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sox12Q04890 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Sox12Q04890 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Sox12Q04890 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sox12Q04890 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sox12Q04890 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sox12Q04890 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sox12Q04890 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sox12Q04890 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sox12Q04890 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Sox12Q04890 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sox12Q04890 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sox12Q04890 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sox12Q04890 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sox12Q04890 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sox12Q04890 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sox12Q04890 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sox12Q04890 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sox12Q04890 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sox12Q04890 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sox12Q04890 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sox12Q04890 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sox12Q04890 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sox12Q04890 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sox12Q04890 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sox12Q04890 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sox12Q04890 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sox12Q04890 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sox12Q04890 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Sox12Q04890 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sox12Q04890 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sox12Q04890 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sox12Q04890 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sox12Q04890 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sox12Q04890 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sox12Q04890 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Sox12Q04890 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sox12Q04890 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sox12Q04890 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Sox12Q04890 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sox12Q04890 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sox12Q04890 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sox12Q04890 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sox12Q04890 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sox12Q04890 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sox12Q04890 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Sox12Q04890 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sox12Q04890 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sox12Q04890 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sox12Q04890 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sox12Q04890 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sox12Q04890 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sox12Q04890 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Sox12Q04890 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sox12Q04890 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sox12Q04890 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms