Protein–RNA interactions for Protein: Q04888

Sox10, Transcription factor SOX-10, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox10Q04888 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sox10Q04888 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sox10Q04888 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sox10Q04888 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sox10Q04888 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sox10Q04888 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Sox10Q04888 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sox10Q04888 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sox10Q04888 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sox10Q04888 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sox10Q04888 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sox10Q04888 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sox10Q04888 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Sox10Q04888 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sox10Q04888 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sox10Q04888 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sox10Q04888 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sox10Q04888 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sox10Q04888 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sox10Q04888 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Sox10Q04888 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Sox10Q04888 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Sox10Q04888 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sox10Q04888 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sox10Q04888 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sox10Q04888 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sox10Q04888 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sox10Q04888 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sox10Q04888 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sox10Q04888 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sox10Q04888 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sox10Q04888 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sox10Q04888 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Sox10Q04888 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sox10Q04888 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sox10Q04888 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sox10Q04888 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sox10Q04888 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sox10Q04888 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sox10Q04888 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sox10Q04888 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sox10Q04888 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sox10Q04888 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sox10Q04888 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sox10Q04888 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sox10Q04888 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sox10Q04888 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sox10Q04888 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Sox10Q04888 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sox10Q04888 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Sox10Q04888 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sox10Q04888 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sox10Q04888 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sox10Q04888 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sox10Q04888 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sox10Q04888 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sox10Q04888 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sox10Q04888 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sox10Q04888 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Sox10Q04888 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sox10Q04888 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sox10Q04888 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sox10Q04888 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sox10Q04888 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sox10Q04888 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Sox10Q04888 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sox10Q04888 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sox10Q04888 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sox10Q04888 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Sox10Q04888 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Sox10Q04888 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sox10Q04888 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sox10Q04888 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sox10Q04888 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sox10Q04888 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sox10Q04888 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Sox10Q04888 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sox10Q04888 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sox10Q04888 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sox10Q04888 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sox10Q04888 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sox10Q04888 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sox10Q04888 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sox10Q04888 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sox10Q04888 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sox10Q04888 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sox10Q04888 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Sox10Q04888 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sox10Q04888 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sox10Q04888 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sox10Q04888 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sox10Q04888 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sox10Q04888 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sox10Q04888 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sox10Q04888 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sox10Q04888 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sox10Q04888 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sox10Q04888 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sox10Q04888 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sox10Q04888 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms