Protein–RNA interactions for Protein: Q04863

Relb, Transcription factor RelB, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelbQ04863 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RelbQ04863 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RelbQ04863 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RelbQ04863 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RelbQ04863 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RelbQ04863 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RelbQ04863 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RelbQ04863 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RelbQ04863 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RelbQ04863 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RelbQ04863 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RelbQ04863 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RelbQ04863 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RelbQ04863 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RelbQ04863 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RelbQ04863 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RelbQ04863 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RelbQ04863 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RelbQ04863 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RelbQ04863 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RelbQ04863 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RelbQ04863 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RelbQ04863 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RelbQ04863 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RelbQ04863 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RelbQ04863 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RelbQ04863 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RelbQ04863 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RelbQ04863 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RelbQ04863 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RelbQ04863 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RelbQ04863 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RelbQ04863 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RelbQ04863 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RelbQ04863 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RelbQ04863 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RelbQ04863 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RelbQ04863 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RelbQ04863 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RelbQ04863 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RelbQ04863 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RelbQ04863 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RelbQ04863 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RelbQ04863 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RelbQ04863 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RelbQ04863 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RelbQ04863 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RelbQ04863 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RelbQ04863 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RelbQ04863 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RelbQ04863 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RelbQ04863 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RelbQ04863 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RelbQ04863 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RelbQ04863 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RelbQ04863 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RelbQ04863 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RelbQ04863 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RelbQ04863 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RelbQ04863 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RelbQ04863 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RelbQ04863 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RelbQ04863 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RelbQ04863 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RelbQ04863 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RelbQ04863 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RelbQ04863 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RelbQ04863 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RelbQ04863 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RelbQ04863 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RelbQ04863 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RelbQ04863 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RelbQ04863 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RelbQ04863 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RelbQ04863 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RelbQ04863 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RelbQ04863 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RelbQ04863 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RelbQ04863 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RelbQ04863 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RelbQ04863 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RelbQ04863 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RelbQ04863 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RelbQ04863 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RelbQ04863 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RelbQ04863 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RelbQ04863 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RelbQ04863 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RelbQ04863 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RelbQ04863 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RelbQ04863 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RelbQ04863 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RelbQ04863 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RelbQ04863 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RelbQ04863 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RelbQ04863 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RelbQ04863 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RelbQ04863 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RelbQ04863 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RelbQ04863 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms