Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cxcr5Q04683 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cxcr5Q04683 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cxcr5Q04683 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cxcr5Q04683 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cxcr5Q04683 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cxcr5Q04683 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cxcr5Q04683 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cxcr5Q04683 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cxcr5Q04683 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cxcr5Q04683 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cxcr5Q04683 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cxcr5Q04683 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cxcr5Q04683 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cxcr5Q04683 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cxcr5Q04683 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cxcr5Q04683 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cxcr5Q04683 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cxcr5Q04683 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cxcr5Q04683 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cxcr5Q04683 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cxcr5Q04683 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cxcr5Q04683 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cxcr5Q04683 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cxcr5Q04683 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cxcr5Q04683 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cxcr5Q04683 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cxcr5Q04683 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cxcr5Q04683 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cxcr5Q04683 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cxcr5Q04683 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cxcr5Q04683 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cxcr5Q04683 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cxcr5Q04683 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cxcr5Q04683 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cxcr5Q04683 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cxcr5Q04683 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cxcr5Q04683 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cxcr5Q04683 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cxcr5Q04683 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cxcr5Q04683 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cxcr5Q04683 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cxcr5Q04683 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cxcr5Q04683 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cxcr5Q04683 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cxcr5Q04683 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cxcr5Q04683 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cxcr5Q04683 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cxcr5Q04683 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cxcr5Q04683 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cxcr5Q04683 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cxcr5Q04683 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cxcr5Q04683 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cxcr5Q04683 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cxcr5Q04683 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cxcr5Q04683 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cxcr5Q04683 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cxcr5Q04683 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cxcr5Q04683 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cxcr5Q04683 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cxcr5Q04683 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cxcr5Q04683 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cxcr5Q04683 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cxcr5Q04683 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cxcr5Q04683 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cxcr5Q04683 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cxcr5Q04683 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cxcr5Q04683 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cxcr5Q04683 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cxcr5Q04683 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cxcr5Q04683 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cxcr5Q04683 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cxcr5Q04683 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cxcr5Q04683 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cxcr5Q04683 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cxcr5Q04683 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cxcr5Q04683 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cxcr5Q04683 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cxcr5Q04683 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cxcr5Q04683 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cxcr5Q04683 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cxcr5Q04683 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cxcr5Q04683 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cxcr5Q04683 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cxcr5Q04683 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cxcr5Q04683 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cxcr5Q04683 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cxcr5Q04683 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cxcr5Q04683 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cxcr5Q04683 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cxcr5Q04683 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cxcr5Q04683 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cxcr5Q04683 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cxcr5Q04683 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cxcr5Q04683 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cxcr5Q04683 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cxcr5Q04683 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cxcr5Q04683 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cxcr5Q04683 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cxcr5Q04683 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms