Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tff2Q03404 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tff2Q03404 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tff2Q03404 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tff2Q03404 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tff2Q03404 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Tff2Q03404 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tff2Q03404 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tff2Q03404 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tff2Q03404 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tff2Q03404 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tff2Q03404 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tff2Q03404 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tff2Q03404 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tff2Q03404 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tff2Q03404 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tff2Q03404 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tff2Q03404 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tff2Q03404 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tff2Q03404 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tff2Q03404 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tff2Q03404 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tff2Q03404 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tff2Q03404 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tff2Q03404 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tff2Q03404 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tff2Q03404 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tff2Q03404 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tff2Q03404 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tff2Q03404 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tff2Q03404 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tff2Q03404 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tff2Q03404 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tff2Q03404 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tff2Q03404 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tff2Q03404 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tff2Q03404 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tff2Q03404 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tff2Q03404 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tff2Q03404 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tff2Q03404 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tff2Q03404 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tff2Q03404 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tff2Q03404 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tff2Q03404 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tff2Q03404 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tff2Q03404 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tff2Q03404 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tff2Q03404 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tff2Q03404 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tff2Q03404 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tff2Q03404 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tff2Q03404 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tff2Q03404 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tff2Q03404 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tff2Q03404 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tff2Q03404 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Tff2Q03404 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tff2Q03404 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tff2Q03404 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tff2Q03404 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Tff2Q03404 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tff2Q03404 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tff2Q03404 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tff2Q03404 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tff2Q03404 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tff2Q03404 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tff2Q03404 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tff2Q03404 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tff2Q03404 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tff2Q03404 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Tff2Q03404 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tff2Q03404 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tff2Q03404 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tff2Q03404 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tff2Q03404 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tff2Q03404 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tff2Q03404 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tff2Q03404 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tff2Q03404 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tff2Q03404 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tff2Q03404 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tff2Q03404 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tff2Q03404 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tff2Q03404 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tff2Q03404 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tff2Q03404 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tff2Q03404 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tff2Q03404 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tff2Q03404 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tff2Q03404 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tff2Q03404 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tff2Q03404 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tff2Q03404 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tff2Q03404 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tff2Q03404 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tff2Q03404 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tff2Q03404 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tff2Q03404 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tff2Q03404 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms