Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RykQ01887 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RykQ01887 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RykQ01887 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RykQ01887 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RykQ01887 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RykQ01887 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RykQ01887 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RykQ01887 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RykQ01887 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RykQ01887 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RykQ01887 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RykQ01887 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RykQ01887 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RykQ01887 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RykQ01887 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RykQ01887 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RykQ01887 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RykQ01887 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RykQ01887 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RykQ01887 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RykQ01887 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RykQ01887 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RykQ01887 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RykQ01887 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RykQ01887 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RykQ01887 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RykQ01887 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RykQ01887 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RykQ01887 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RykQ01887 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RykQ01887 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RykQ01887 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RykQ01887 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RykQ01887 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RykQ01887 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RykQ01887 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RykQ01887 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RykQ01887 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RykQ01887 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RykQ01887 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RykQ01887 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RykQ01887 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RykQ01887 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RykQ01887 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RykQ01887 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RykQ01887 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RykQ01887 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RykQ01887 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RykQ01887 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RykQ01887 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RykQ01887 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RykQ01887 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RykQ01887 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RykQ01887 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RykQ01887 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RykQ01887 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RykQ01887 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RykQ01887 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RykQ01887 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RykQ01887 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RykQ01887 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RykQ01887 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RykQ01887 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RykQ01887 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RykQ01887 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RykQ01887 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RykQ01887 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RykQ01887 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RykQ01887 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RykQ01887 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RykQ01887 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RykQ01887 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RykQ01887 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RykQ01887 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RykQ01887 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RykQ01887 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RykQ01887 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RykQ01887 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RykQ01887 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RykQ01887 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RykQ01887 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RykQ01887 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RykQ01887 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RykQ01887 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RykQ01887 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RykQ01887 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RykQ01887 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RykQ01887 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RykQ01887 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RykQ01887 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RykQ01887 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RykQ01887 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RykQ01887 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RykQ01887 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RykQ01887 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RykQ01887 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RykQ01887 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RykQ01887 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RykQ01887 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms