Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cacna1cQ01815 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cacna1cQ01815 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cacna1cQ01815 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cacna1cQ01815 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cacna1cQ01815 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cacna1cQ01815 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cacna1cQ01815 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cacna1cQ01815 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cacna1cQ01815 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cacna1cQ01815 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cacna1cQ01815 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cacna1cQ01815 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cacna1cQ01815 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cacna1cQ01815 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cacna1cQ01815 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cacna1cQ01815 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cacna1cQ01815 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cacna1cQ01815 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cacna1cQ01815 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cacna1cQ01815 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cacna1cQ01815 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cacna1cQ01815 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cacna1cQ01815 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cacna1cQ01815 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cacna1cQ01815 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cacna1cQ01815 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacna1cQ01815 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacna1cQ01815 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacna1cQ01815 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacna1cQ01815 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacna1cQ01815 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacna1cQ01815 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacna1cQ01815 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacna1cQ01815 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacna1cQ01815 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacna1cQ01815 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacna1cQ01815 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacna1cQ01815 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacna1cQ01815 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacna1cQ01815 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacna1cQ01815 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cacna1cQ01815 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cacna1cQ01815 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cacna1cQ01815 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cacna1cQ01815 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cacna1cQ01815 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cacna1cQ01815 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cacna1cQ01815 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cacna1cQ01815 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Cacna1cQ01815 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cacna1cQ01815 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cacna1cQ01815 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cacna1cQ01815 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cacna1cQ01815 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cacna1cQ01815 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cacna1cQ01815 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cacna1cQ01815 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cacna1cQ01815 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cacna1cQ01815 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cacna1cQ01815 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cacna1cQ01815 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cacna1cQ01815 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cacna1cQ01815 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cacna1cQ01815 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cacna1cQ01815 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cacna1cQ01815 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cacna1cQ01815 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacna1cQ01815 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacna1cQ01815 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacna1cQ01815 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacna1cQ01815 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacna1cQ01815 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacna1cQ01815 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacna1cQ01815 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacna1cQ01815 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacna1cQ01815 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacna1cQ01815 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacna1cQ01815 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacna1cQ01815 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacna1cQ01815 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacna1cQ01815 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacna1cQ01815 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacna1cQ01815 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cacna1cQ01815 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cacna1cQ01815 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cacna1cQ01815 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cacna1cQ01815 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cacna1cQ01815 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cacna1cQ01815 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cacna1cQ01815 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cacna1cQ01815 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cacna1cQ01815 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cacna1cQ01815 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cacna1cQ01815 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cacna1cQ01815 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacna1cQ01815 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacna1cQ01815 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacna1cQ01815 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacna1cQ01815 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms