Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sec23aQ01405 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sec23aQ01405 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sec23aQ01405 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sec23aQ01405 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Sec23aQ01405 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sec23aQ01405 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sec23aQ01405 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sec23aQ01405 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sec23aQ01405 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sec23aQ01405 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sec23aQ01405 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sec23aQ01405 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sec23aQ01405 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Sec23aQ01405 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sec23aQ01405 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sec23aQ01405 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sec23aQ01405 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sec23aQ01405 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sec23aQ01405 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sec23aQ01405 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sec23aQ01405 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sec23aQ01405 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sec23aQ01405 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sec23aQ01405 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sec23aQ01405 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sec23aQ01405 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sec23aQ01405 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sec23aQ01405 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Sec23aQ01405 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sec23aQ01405 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sec23aQ01405 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sec23aQ01405 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Sec23aQ01405 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sec23aQ01405 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sec23aQ01405 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sec23aQ01405 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sec23aQ01405 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sec23aQ01405 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sec23aQ01405 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sec23aQ01405 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sec23aQ01405 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sec23aQ01405 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sec23aQ01405 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sec23aQ01405 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sec23aQ01405 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sec23aQ01405 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sec23aQ01405 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sec23aQ01405 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sec23aQ01405 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sec23aQ01405 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sec23aQ01405 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sec23aQ01405 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sec23aQ01405 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sec23aQ01405 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sec23aQ01405 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sec23aQ01405 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sec23aQ01405 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sec23aQ01405 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sec23aQ01405 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sec23aQ01405 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sec23aQ01405 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sec23aQ01405 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sec23aQ01405 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sec23aQ01405 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sec23aQ01405 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sec23aQ01405 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sec23aQ01405 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sec23aQ01405 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sec23aQ01405 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sec23aQ01405 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sec23aQ01405 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sec23aQ01405 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sec23aQ01405 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sec23aQ01405 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sec23aQ01405 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Sec23aQ01405 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sec23aQ01405 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sec23aQ01405 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sec23aQ01405 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sec23aQ01405 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sec23aQ01405 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sec23aQ01405 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sec23aQ01405 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sec23aQ01405 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sec23aQ01405 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sec23aQ01405 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sec23aQ01405 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sec23aQ01405 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sec23aQ01405 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sec23aQ01405 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sec23aQ01405 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Sec23aQ01405 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sec23aQ01405 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sec23aQ01405 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sec23aQ01405 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sec23aQ01405 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sec23aQ01405 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sec23aQ01405 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sec23aQ01405 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms