Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Gja5Q01231 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Gja5Q01231 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gja5Q01231 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gja5Q01231 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gja5Q01231 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gja5Q01231 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gja5Q01231 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gja5Q01231 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gja5Q01231 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Gja5Q01231 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gja5Q01231 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gja5Q01231 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gja5Q01231 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gja5Q01231 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gja5Q01231 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Gja5Q01231 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gja5Q01231 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gja5Q01231 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Gja5Q01231 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gja5Q01231 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gja5Q01231 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gja5Q01231 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gja5Q01231 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gja5Q01231 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gja5Q01231 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gja5Q01231 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gja5Q01231 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gja5Q01231 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gja5Q01231 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gja5Q01231 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gja5Q01231 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gja5Q01231 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gja5Q01231 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gja5Q01231 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gja5Q01231 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gja5Q01231 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Gja5Q01231 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gja5Q01231 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gja5Q01231 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gja5Q01231 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gja5Q01231 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gja5Q01231 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gja5Q01231 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gja5Q01231 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gja5Q01231 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Gja5Q01231 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Gja5Q01231 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gja5Q01231 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gja5Q01231 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gja5Q01231 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gja5Q01231 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gja5Q01231 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gja5Q01231 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gja5Q01231 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gja5Q01231 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gja5Q01231 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gja5Q01231 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gja5Q01231 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gja5Q01231 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gja5Q01231 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gja5Q01231 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gja5Q01231 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gja5Q01231 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gja5Q01231 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gja5Q01231 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Gja5Q01231 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gja5Q01231 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gja5Q01231 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gja5Q01231 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gja5Q01231 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gja5Q01231 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gja5Q01231 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gja5Q01231 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gja5Q01231 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Gja5Q01231 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gja5Q01231 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gja5Q01231 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gja5Q01231 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gja5Q01231 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gja5Q01231 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Gja5Q01231 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gja5Q01231 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gja5Q01231 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gja5Q01231 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gja5Q01231 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gja5Q01231 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gja5Q01231 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gja5Q01231 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gja5Q01231 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gja5Q01231 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gja5Q01231 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gja5Q01231 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Gja5Q01231 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gja5Q01231 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gja5Q01231 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gja5Q01231 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gja5Q01231 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gja5Q01231 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gja5Q01231 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms