Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Grin2cQ01098 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Grin2cQ01098 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Grin2cQ01098 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Grin2cQ01098 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Grin2cQ01098 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Grin2cQ01098 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Grin2cQ01098 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Grin2cQ01098 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Grin2cQ01098 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Grin2cQ01098 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Grin2cQ01098 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Grin2cQ01098 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Grin2cQ01098 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Grin2cQ01098 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Grin2cQ01098 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Grin2cQ01098 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Grin2cQ01098 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Grin2cQ01098 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Grin2cQ01098 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Grin2cQ01098 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Grin2cQ01098 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Grin2cQ01098 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Grin2cQ01098 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Grin2cQ01098 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Grin2cQ01098 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Grin2cQ01098 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Grin2cQ01098 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Grin2cQ01098 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Grin2cQ01098 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Grin2cQ01098 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Grin2cQ01098 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Grin2cQ01098 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Grin2cQ01098 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Grin2cQ01098 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Grin2cQ01098 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Grin2cQ01098 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Grin2cQ01098 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Grin2cQ01098 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Grin2cQ01098 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Grin2cQ01098 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Grin2cQ01098 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Grin2cQ01098 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Grin2cQ01098 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Grin2cQ01098 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Grin2cQ01098 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Grin2cQ01098 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Grin2cQ01098 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Grin2cQ01098 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Grin2cQ01098 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Grin2cQ01098 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Grin2cQ01098 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Grin2cQ01098 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Grin2cQ01098 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Grin2cQ01098 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Grin2cQ01098 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Grin2cQ01098 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Grin2cQ01098 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Grin2cQ01098 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Grin2cQ01098 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Grin2cQ01098 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Grin2cQ01098 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Grin2cQ01098 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Grin2cQ01098 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Grin2cQ01098 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Grin2cQ01098 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Grin2cQ01098 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Grin2cQ01098 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Grin2cQ01098 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Grin2cQ01098 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Grin2cQ01098 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Grin2cQ01098 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Grin2cQ01098 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Grin2cQ01098 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Grin2cQ01098 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Grin2cQ01098 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Grin2cQ01098 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Grin2cQ01098 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Grin2cQ01098 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Grin2cQ01098 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Grin2cQ01098 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Grin2cQ01098 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Grin2cQ01098 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Grin2cQ01098 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Grin2cQ01098 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Grin2cQ01098 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Grin2cQ01098 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Grin2cQ01098 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Grin2cQ01098 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Grin2cQ01098 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Grin2cQ01098 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Grin2cQ01098 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Grin2cQ01098 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Grin2cQ01098 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Grin2cQ01098 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Grin2cQ01098 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Grin2cQ01098 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Grin2cQ01098 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Grin2cQ01098 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Grin2cQ01098 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms