Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VegfaQ00731 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VegfaQ00731 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VegfaQ00731 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VegfaQ00731 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VegfaQ00731 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VegfaQ00731 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VegfaQ00731 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VegfaQ00731 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VegfaQ00731 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
VegfaQ00731 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VegfaQ00731 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VegfaQ00731 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VegfaQ00731 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VegfaQ00731 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VegfaQ00731 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VegfaQ00731 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VegfaQ00731 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VegfaQ00731 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VegfaQ00731 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VegfaQ00731 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VegfaQ00731 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VegfaQ00731 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VegfaQ00731 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VegfaQ00731 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VegfaQ00731 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VegfaQ00731 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VegfaQ00731 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VegfaQ00731 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VegfaQ00731 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
VegfaQ00731 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VegfaQ00731 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VegfaQ00731 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VegfaQ00731 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VegfaQ00731 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VegfaQ00731 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VegfaQ00731 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VegfaQ00731 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VegfaQ00731 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VegfaQ00731 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VegfaQ00731 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VegfaQ00731 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VegfaQ00731 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VegfaQ00731 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VegfaQ00731 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VegfaQ00731 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VegfaQ00731 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VegfaQ00731 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VegfaQ00731 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
VegfaQ00731 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VegfaQ00731 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VegfaQ00731 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VegfaQ00731 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VegfaQ00731 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VegfaQ00731 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VegfaQ00731 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VegfaQ00731 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VegfaQ00731 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
VegfaQ00731 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
VegfaQ00731 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
VegfaQ00731 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VegfaQ00731 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VegfaQ00731 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VegfaQ00731 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
VegfaQ00731 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VegfaQ00731 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VegfaQ00731 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VegfaQ00731 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VegfaQ00731 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
VegfaQ00731 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VegfaQ00731 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VegfaQ00731 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VegfaQ00731 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VegfaQ00731 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VegfaQ00731 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VegfaQ00731 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VegfaQ00731 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VegfaQ00731 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VegfaQ00731 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VegfaQ00731 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VegfaQ00731 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VegfaQ00731 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VegfaQ00731 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VegfaQ00731 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VegfaQ00731 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VegfaQ00731 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VegfaQ00731 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VegfaQ00731 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VegfaQ00731 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VegfaQ00731 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VegfaQ00731 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VegfaQ00731 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VegfaQ00731 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
VegfaQ00731 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
VegfaQ00731 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VegfaQ00731 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
VegfaQ00731 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VegfaQ00731 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VegfaQ00731 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VegfaQ00731 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms