Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gabpb1Q00420 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gabpb1Q00420 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gabpb1Q00420 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gabpb1Q00420 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gabpb1Q00420 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gabpb1Q00420 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gabpb1Q00420 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gabpb1Q00420 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gabpb1Q00420 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gabpb1Q00420 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gabpb1Q00420 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gabpb1Q00420 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gabpb1Q00420 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gabpb1Q00420 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gabpb1Q00420 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gabpb1Q00420 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gabpb1Q00420 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gabpb1Q00420 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gabpb1Q00420 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gabpb1Q00420 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gabpb1Q00420 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gabpb1Q00420 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gabpb1Q00420 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gabpb1Q00420 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gabpb1Q00420 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gabpb1Q00420 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gabpb1Q00420 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Gabpb1Q00420 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Gabpb1Q00420 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gabpb1Q00420 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gabpb1Q00420 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gabpb1Q00420 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gabpb1Q00420 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gabpb1Q00420 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gabpb1Q00420 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gabpb1Q00420 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gabpb1Q00420 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gabpb1Q00420 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gabpb1Q00420 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gabpb1Q00420 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gabpb1Q00420 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Gabpb1Q00420 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gabpb1Q00420 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gabpb1Q00420 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gabpb1Q00420 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gabpb1Q00420 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gabpb1Q00420 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gabpb1Q00420 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gabpb1Q00420 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gabpb1Q00420 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Gabpb1Q00420 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gabpb1Q00420 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gabpb1Q00420 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gabpb1Q00420 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gabpb1Q00420 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Gabpb1Q00420 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gabpb1Q00420 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gabpb1Q00420 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gabpb1Q00420 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gabpb1Q00420 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gabpb1Q00420 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gabpb1Q00420 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gabpb1Q00420 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gabpb1Q00420 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gabpb1Q00420 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gabpb1Q00420 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gabpb1Q00420 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gabpb1Q00420 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gabpb1Q00420 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gabpb1Q00420 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gabpb1Q00420 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gabpb1Q00420 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gabpb1Q00420 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gabpb1Q00420 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gabpb1Q00420 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gabpb1Q00420 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gabpb1Q00420 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gabpb1Q00420 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gabpb1Q00420 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gabpb1Q00420 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gabpb1Q00420 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gabpb1Q00420 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gabpb1Q00420 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gabpb1Q00420 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gabpb1Q00420 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gabpb1Q00420 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gabpb1Q00420 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gabpb1Q00420 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gabpb1Q00420 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gabpb1Q00420 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gabpb1Q00420 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gabpb1Q00420 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Gabpb1Q00420 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gabpb1Q00420 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gabpb1Q00420 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gabpb1Q00420 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Gabpb1Q00420 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gabpb1Q00420 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gabpb1Q00420 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 195.9 ms