Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pitx2P97474 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pitx2P97474 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pitx2P97474 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Pitx2P97474 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pitx2P97474 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pitx2P97474 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pitx2P97474 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pitx2P97474 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pitx2P97474 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pitx2P97474 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pitx2P97474 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pitx2P97474 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pitx2P97474 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pitx2P97474 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pitx2P97474 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pitx2P97474 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pitx2P97474 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pitx2P97474 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pitx2P97474 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pitx2P97474 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pitx2P97474 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pitx2P97474 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pitx2P97474 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pitx2P97474 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pitx2P97474 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pitx2P97474 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pitx2P97474 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pitx2P97474 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pitx2P97474 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pitx2P97474 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pitx2P97474 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pitx2P97474 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pitx2P97474 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pitx2P97474 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Pitx2P97474 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Pitx2P97474 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pitx2P97474 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Pitx2P97474 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pitx2P97474 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pitx2P97474 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pitx2P97474 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pitx2P97474 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pitx2P97474 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pitx2P97474 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Pitx2P97474 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pitx2P97474 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pitx2P97474 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pitx2P97474 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Pitx2P97474 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pitx2P97474 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Pitx2P97474 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pitx2P97474 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pitx2P97474 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pitx2P97474 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pitx2P97474 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pitx2P97474 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pitx2P97474 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pitx2P97474 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pitx2P97474 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pitx2P97474 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pitx2P97474 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pitx2P97474 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pitx2P97474 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pitx2P97474 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pitx2P97474 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pitx2P97474 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pitx2P97474 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pitx2P97474 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pitx2P97474 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pitx2P97474 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pitx2P97474 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pitx2P97474 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pitx2P97474 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pitx2P97474 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pitx2P97474 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pitx2P97474 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Pitx2P97474 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pitx2P97474 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pitx2P97474 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pitx2P97474 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pitx2P97474 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Pitx2P97474 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pitx2P97474 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pitx2P97474 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pitx2P97474 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pitx2P97474 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pitx2P97474 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pitx2P97474 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pitx2P97474 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pitx2P97474 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pitx2P97474 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pitx2P97474 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pitx2P97474 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pitx2P97474 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pitx2P97474 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pitx2P97474 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pitx2P97474 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Pitx2P97474 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pitx2P97474 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms