Protein–RNA interactions for Protein: P97412

Lyst, Lysosomal-trafficking regulator, mousemouse

Predictions only

Length 3,788 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LystP97412 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LystP97412 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LystP97412 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LystP97412 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LystP97412 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LystP97412 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LystP97412 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LystP97412 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LystP97412 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LystP97412 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LystP97412 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LystP97412 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LystP97412 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LystP97412 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LystP97412 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LystP97412 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LystP97412 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LystP97412 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LystP97412 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LystP97412 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LystP97412 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LystP97412 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LystP97412 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LystP97412 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LystP97412 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LystP97412 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LystP97412 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LystP97412 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LystP97412 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LystP97412 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LystP97412 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LystP97412 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LystP97412 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LystP97412 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LystP97412 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LystP97412 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LystP97412 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LystP97412 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LystP97412 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LystP97412 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LystP97412 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LystP97412 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LystP97412 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LystP97412 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LystP97412 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LystP97412 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LystP97412 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LystP97412 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LystP97412 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LystP97412 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LystP97412 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LystP97412 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LystP97412 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LystP97412 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LystP97412 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LystP97412 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LystP97412 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LystP97412 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LystP97412 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LystP97412 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LystP97412 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LystP97412 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LystP97412 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LystP97412 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LystP97412 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LystP97412 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LystP97412 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LystP97412 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LystP97412 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LystP97412 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LystP97412 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LystP97412 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LystP97412 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LystP97412 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LystP97412 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LystP97412 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LystP97412 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LystP97412 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LystP97412 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LystP97412 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LystP97412 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LystP97412 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LystP97412 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LystP97412 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LystP97412 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LystP97412 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LystP97412 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
LystP97412 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
LystP97412 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LystP97412 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LystP97412 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LystP97412 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LystP97412 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LystP97412 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LystP97412 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LystP97412 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LystP97412 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LystP97412 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LystP97412 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LystP97412 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms