Protein–RNA interactions for Protein: P97355

Sms, Spermine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmsP97355 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SmsP97355 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SmsP97355 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SmsP97355 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SmsP97355 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SmsP97355 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SmsP97355 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SmsP97355 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SmsP97355 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SmsP97355 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SmsP97355 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SmsP97355 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SmsP97355 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SmsP97355 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SmsP97355 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SmsP97355 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SmsP97355 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SmsP97355 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SmsP97355 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SmsP97355 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SmsP97355 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SmsP97355 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SmsP97355 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SmsP97355 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SmsP97355 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SmsP97355 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SmsP97355 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SmsP97355 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SmsP97355 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SmsP97355 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SmsP97355 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SmsP97355 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SmsP97355 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SmsP97355 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SmsP97355 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SmsP97355 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SmsP97355 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SmsP97355 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SmsP97355 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SmsP97355 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SmsP97355 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SmsP97355 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SmsP97355 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SmsP97355 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SmsP97355 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SmsP97355 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SmsP97355 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SmsP97355 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SmsP97355 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SmsP97355 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SmsP97355 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SmsP97355 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
SmsP97355 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SmsP97355 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SmsP97355 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SmsP97355 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SmsP97355 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SmsP97355 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SmsP97355 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SmsP97355 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SmsP97355 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SmsP97355 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SmsP97355 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SmsP97355 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SmsP97355 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SmsP97355 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SmsP97355 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SmsP97355 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SmsP97355 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SmsP97355 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SmsP97355 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SmsP97355 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SmsP97355 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SmsP97355 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SmsP97355 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SmsP97355 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SmsP97355 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SmsP97355 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SmsP97355 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SmsP97355 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SmsP97355 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SmsP97355 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SmsP97355 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SmsP97355 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SmsP97355 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SmsP97355 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SmsP97355 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SmsP97355 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SmsP97355 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SmsP97355 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SmsP97355 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SmsP97355 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SmsP97355 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SmsP97355 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SmsP97355 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SmsP97355 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SmsP97355 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SmsP97355 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SmsP97355 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SmsP97355 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
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