Protein–RNA interactions for Protein: P97351

Rps3a, 40S ribosomal protein S3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3aP97351 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps3aP97351 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps3aP97351 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps3aP97351 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps3aP97351 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps3aP97351 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rps3aP97351 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rps3aP97351 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rps3aP97351 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rps3aP97351 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Rps3aP97351 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rps3aP97351 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rps3aP97351 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rps3aP97351 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rps3aP97351 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rps3aP97351 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rps3aP97351 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps3aP97351 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps3aP97351 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps3aP97351 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps3aP97351 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps3aP97351 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps3aP97351 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps3aP97351 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps3aP97351 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps3aP97351 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps3aP97351 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps3aP97351 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps3aP97351 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps3aP97351 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps3aP97351 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps3aP97351 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps3aP97351 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps3aP97351 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps3aP97351 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps3aP97351 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps3aP97351 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps3aP97351 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps3aP97351 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps3aP97351 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps3aP97351 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps3aP97351 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps3aP97351 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps3aP97351 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps3aP97351 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps3aP97351 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps3aP97351 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps3aP97351 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps3aP97351 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps3aP97351 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps3aP97351 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps3aP97351 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps3aP97351 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps3aP97351 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps3aP97351 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps3aP97351 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps3aP97351 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps3aP97351 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps3aP97351 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps3aP97351 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps3aP97351 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps3aP97351 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps3aP97351 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps3aP97351 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps3aP97351 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps3aP97351 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps3aP97351 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps3aP97351 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps3aP97351 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps3aP97351 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps3aP97351 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps3aP97351 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps3aP97351 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps3aP97351 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps3aP97351 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps3aP97351 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps3aP97351 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps3aP97351 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps3aP97351 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps3aP97351 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps3aP97351 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps3aP97351 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps3aP97351 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps3aP97351 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps3aP97351 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps3aP97351 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps3aP97351 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps3aP97351 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps3aP97351 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps3aP97351 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps3aP97351 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps3aP97351 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps3aP97351 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps3aP97351 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps3aP97351 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps3aP97351 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps3aP97351 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps3aP97351 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps3aP97351 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rps3aP97351 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms