Protein–RNA interactions for Protein: P97348

Rhod, Rho-related GTP-binding protein RhoD, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhodP97348 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RhodP97348 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RhodP97348 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RhodP97348 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RhodP97348 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RhodP97348 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RhodP97348 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RhodP97348 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RhodP97348 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RhodP97348 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RhodP97348 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RhodP97348 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RhodP97348 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RhodP97348 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RhodP97348 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RhodP97348 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RhodP97348 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RhodP97348 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RhodP97348 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RhodP97348 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RhodP97348 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RhodP97348 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RhodP97348 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RhodP97348 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RhodP97348 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RhodP97348 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RhodP97348 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RhodP97348 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RhodP97348 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RhodP97348 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RhodP97348 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RhodP97348 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RhodP97348 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RhodP97348 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RhodP97348 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RhodP97348 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RhodP97348 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RhodP97348 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RhodP97348 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RhodP97348 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RhodP97348 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RhodP97348 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RhodP97348 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RhodP97348 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RhodP97348 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RhodP97348 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RhodP97348 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RhodP97348 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RhodP97348 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RhodP97348 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RhodP97348 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RhodP97348 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RhodP97348 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RhodP97348 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RhodP97348 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RhodP97348 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RhodP97348 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RhodP97348 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RhodP97348 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RhodP97348 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RhodP97348 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RhodP97348 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RhodP97348 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RhodP97348 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RhodP97348 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RhodP97348 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RhodP97348 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RhodP97348 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RhodP97348 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RhodP97348 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RhodP97348 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RhodP97348 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RhodP97348 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RhodP97348 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RhodP97348 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RhodP97348 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RhodP97348 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RhodP97348 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RhodP97348 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
RhodP97348 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RhodP97348 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RhodP97348 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RhodP97348 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RhodP97348 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RhodP97348 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RhodP97348 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RhodP97348 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RhodP97348 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RhodP97348 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RhodP97348 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RhodP97348 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RhodP97348 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RhodP97348 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RhodP97348 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RhodP97348 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RhodP97348 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RhodP97348 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RhodP97348 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RhodP97348 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RhodP97348 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms