Protein–RNA interactions for Protein: P97334

Nkx2-3, Homeobox protein Nkx-2.3, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-3P97334 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nkx2-3P97334 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nkx2-3P97334 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nkx2-3P97334 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nkx2-3P97334 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nkx2-3P97334 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nkx2-3P97334 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nkx2-3P97334 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nkx2-3P97334 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nkx2-3P97334 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nkx2-3P97334 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Nkx2-3P97334 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Nkx2-3P97334 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nkx2-3P97334 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nkx2-3P97334 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nkx2-3P97334 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nkx2-3P97334 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nkx2-3P97334 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nkx2-3P97334 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nkx2-3P97334 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nkx2-3P97334 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nkx2-3P97334 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nkx2-3P97334 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nkx2-3P97334 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nkx2-3P97334 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nkx2-3P97334 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nkx2-3P97334 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nkx2-3P97334 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nkx2-3P97334 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nkx2-3P97334 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nkx2-3P97334 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nkx2-3P97334 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nkx2-3P97334 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nkx2-3P97334 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nkx2-3P97334 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nkx2-3P97334 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nkx2-3P97334 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nkx2-3P97334 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nkx2-3P97334 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nkx2-3P97334 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nkx2-3P97334 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Nkx2-3P97334 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nkx2-3P97334 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nkx2-3P97334 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nkx2-3P97334 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nkx2-3P97334 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nkx2-3P97334 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nkx2-3P97334 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nkx2-3P97334 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nkx2-3P97334 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nkx2-3P97334 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nkx2-3P97334 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nkx2-3P97334 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nkx2-3P97334 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nkx2-3P97334 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nkx2-3P97334 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nkx2-3P97334 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nkx2-3P97334 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nkx2-3P97334 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nkx2-3P97334 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nkx2-3P97334 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nkx2-3P97334 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nkx2-3P97334 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nkx2-3P97334 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nkx2-3P97334 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Nkx2-3P97334 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nkx2-3P97334 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nkx2-3P97334 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Nkx2-3P97334 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nkx2-3P97334 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nkx2-3P97334 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nkx2-3P97334 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nkx2-3P97334 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nkx2-3P97334 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nkx2-3P97334 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nkx2-3P97334 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nkx2-3P97334 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nkx2-3P97334 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nkx2-3P97334 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nkx2-3P97334 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nkx2-3P97334 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nkx2-3P97334 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nkx2-3P97334 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nkx2-3P97334 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nkx2-3P97334 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nkx2-3P97334 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Nkx2-3P97334 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nkx2-3P97334 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nkx2-3P97334 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nkx2-3P97334 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nkx2-3P97334 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nkx2-3P97334 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nkx2-3P97334 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nkx2-3P97334 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nkx2-3P97334 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nkx2-3P97334 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nkx2-3P97334 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nkx2-3P97334 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nkx2-3P97334 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nkx2-3P97334 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms