Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mesp1P97309 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mesp1P97309 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Mesp1P97309 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mesp1P97309 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mesp1P97309 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mesp1P97309 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mesp1P97309 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mesp1P97309 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mesp1P97309 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mesp1P97309 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mesp1P97309 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mesp1P97309 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mesp1P97309 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mesp1P97309 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mesp1P97309 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mesp1P97309 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mesp1P97309 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mesp1P97309 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mesp1P97309 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mesp1P97309 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mesp1P97309 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mesp1P97309 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mesp1P97309 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mesp1P97309 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mesp1P97309 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mesp1P97309 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mesp1P97309 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mesp1P97309 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mesp1P97309 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mesp1P97309 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mesp1P97309 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mesp1P97309 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mesp1P97309 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mesp1P97309 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mesp1P97309 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mesp1P97309 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mesp1P97309 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Mesp1P97309 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Mesp1P97309 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Mesp1P97309 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Mesp1P97309 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mesp1P97309 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mesp1P97309 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mesp1P97309 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mesp1P97309 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mesp1P97309 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mesp1P97309 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Mesp1P97309 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mesp1P97309 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Mesp1P97309 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mesp1P97309 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mesp1P97309 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mesp1P97309 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mesp1P97309 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mesp1P97309 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mesp1P97309 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mesp1P97309 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mesp1P97309 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mesp1P97309 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Mesp1P97309 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mesp1P97309 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mesp1P97309 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mesp1P97309 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mesp1P97309 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mesp1P97309 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mesp1P97309 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mesp1P97309 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mesp1P97309 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mesp1P97309 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mesp1P97309 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mesp1P97309 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mesp1P97309 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mesp1P97309 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mesp1P97309 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mesp1P97309 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mesp1P97309 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mesp1P97309 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mesp1P97309 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mesp1P97309 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mesp1P97309 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Mesp1P97309 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mesp1P97309 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mesp1P97309 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mesp1P97309 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mesp1P97309 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Mesp1P97309 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mesp1P97309 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mesp1P97309 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mesp1P97309 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mesp1P97309 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mesp1P97309 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mesp1P97309 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mesp1P97309 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mesp1P97309 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mesp1P97309 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mesp1P97309 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mesp1P97309 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mesp1P97309 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mesp1P97309 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms