Protein–RNA interactions for Protein: P83887

Tubg1, Tubulin gamma-1 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg1P83887 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tubg1P83887 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tubg1P83887 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tubg1P83887 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tubg1P83887 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tubg1P83887 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tubg1P83887 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tubg1P83887 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tubg1P83887 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tubg1P83887 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tubg1P83887 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tubg1P83887 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tubg1P83887 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tubg1P83887 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tubg1P83887 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubg1P83887 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubg1P83887 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubg1P83887 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubg1P83887 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubg1P83887 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubg1P83887 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubg1P83887 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubg1P83887 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubg1P83887 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubg1P83887 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubg1P83887 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubg1P83887 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubg1P83887 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubg1P83887 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubg1P83887 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubg1P83887 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubg1P83887 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubg1P83887 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubg1P83887 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubg1P83887 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubg1P83887 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubg1P83887 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubg1P83887 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubg1P83887 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubg1P83887 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubg1P83887 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubg1P83887 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubg1P83887 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubg1P83887 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubg1P83887 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubg1P83887 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubg1P83887 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubg1P83887 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubg1P83887 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubg1P83887 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubg1P83887 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tubg1P83887 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tubg1P83887 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tubg1P83887 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tubg1P83887 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tubg1P83887 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tubg1P83887 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tubg1P83887 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tubg1P83887 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tubg1P83887 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tubg1P83887 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tubg1P83887 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tubg1P83887 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tubg1P83887 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tubg1P83887 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tubg1P83887 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tubg1P83887 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubg1P83887 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubg1P83887 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubg1P83887 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubg1P83887 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubg1P83887 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubg1P83887 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubg1P83887 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubg1P83887 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubg1P83887 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubg1P83887 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubg1P83887 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubg1P83887 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubg1P83887 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubg1P83887 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubg1P83887 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubg1P83887 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubg1P83887 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubg1P83887 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubg1P83887 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubg1P83887 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubg1P83887 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubg1P83887 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubg1P83887 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubg1P83887 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubg1P83887 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubg1P83887 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubg1P83887 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubg1P83887 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubg1P83887 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubg1P83887 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubg1P83887 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubg1P83887 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubg1P83887 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms