Protein–RNA interactions for Protein: P81117

Nucb2, Nucleobindin-2, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nucb2P81117 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nucb2P81117 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nucb2P81117 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nucb2P81117 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nucb2P81117 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nucb2P81117 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nucb2P81117 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nucb2P81117 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nucb2P81117 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nucb2P81117 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nucb2P81117 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nucb2P81117 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nucb2P81117 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nucb2P81117 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nucb2P81117 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nucb2P81117 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nucb2P81117 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nucb2P81117 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nucb2P81117 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nucb2P81117 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nucb2P81117 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Nucb2P81117 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nucb2P81117 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nucb2P81117 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nucb2P81117 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nucb2P81117 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nucb2P81117 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nucb2P81117 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nucb2P81117 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Nucb2P81117 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nucb2P81117 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nucb2P81117 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Nucb2P81117 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nucb2P81117 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nucb2P81117 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nucb2P81117 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nucb2P81117 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nucb2P81117 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nucb2P81117 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nucb2P81117 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nucb2P81117 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nucb2P81117 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nucb2P81117 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nucb2P81117 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nucb2P81117 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nucb2P81117 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nucb2P81117 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Nucb2P81117 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nucb2P81117 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nucb2P81117 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nucb2P81117 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nucb2P81117 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nucb2P81117 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nucb2P81117 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nucb2P81117 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nucb2P81117 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nucb2P81117 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nucb2P81117 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nucb2P81117 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nucb2P81117 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nucb2P81117 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nucb2P81117 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nucb2P81117 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nucb2P81117 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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Nucb2P81117 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nucb2P81117 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nucb2P81117 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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Nucb2P81117 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nucb2P81117 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nucb2P81117 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nucb2P81117 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nucb2P81117 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nucb2P81117 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nucb2P81117 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nucb2P81117 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nucb2P81117 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nucb2P81117 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nucb2P81117 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nucb2P81117 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nucb2P81117 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nucb2P81117 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nucb2P81117 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nucb2P81117 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nucb2P81117 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nucb2P81117 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nucb2P81117 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nucb2P81117 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nucb2P81117 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nucb2P81117 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nucb2P81117 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nucb2P81117 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nucb2P81117 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nucb2P81117 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nucb2P81117 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nucb2P81117 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nucb2P81117 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nucb2P81117 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms