Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Gabpb2P81069 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Gabpb2P81069 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gabpb2P81069 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gabpb2P81069 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gabpb2P81069 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gabpb2P81069 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gabpb2P81069 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gabpb2P81069 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Gabpb2P81069 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gabpb2P81069 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gabpb2P81069 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Gabpb2P81069 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Gabpb2P81069 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Gabpb2P81069 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gabpb2P81069 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gabpb2P81069 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gabpb2P81069 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gabpb2P81069 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gabpb2P81069 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gabpb2P81069 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gabpb2P81069 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gabpb2P81069 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Gabpb2P81069 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gabpb2P81069 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gabpb2P81069 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gabpb2P81069 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gabpb2P81069 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gabpb2P81069 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gabpb2P81069 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gabpb2P81069 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gabpb2P81069 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gabpb2P81069 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Gabpb2P81069 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gabpb2P81069 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gabpb2P81069 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gabpb2P81069 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gabpb2P81069 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gabpb2P81069 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gabpb2P81069 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gabpb2P81069 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gabpb2P81069 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gabpb2P81069 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gabpb2P81069 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gabpb2P81069 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gabpb2P81069 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gabpb2P81069 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gabpb2P81069 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gabpb2P81069 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gabpb2P81069 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gabpb2P81069 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gabpb2P81069 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gabpb2P81069 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gabpb2P81069 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gabpb2P81069 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gabpb2P81069 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gabpb2P81069 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gabpb2P81069 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gabpb2P81069 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gabpb2P81069 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gabpb2P81069 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gabpb2P81069 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gabpb2P81069 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gabpb2P81069 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gabpb2P81069 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Gabpb2P81069 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gabpb2P81069 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gabpb2P81069 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gabpb2P81069 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Gabpb2P81069 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gabpb2P81069 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gabpb2P81069 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gabpb2P81069 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Gabpb2P81069 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gabpb2P81069 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gabpb2P81069 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gabpb2P81069 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gabpb2P81069 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gabpb2P81069 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gabpb2P81069 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gabpb2P81069 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gabpb2P81069 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Gabpb2P81069 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gabpb2P81069 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gabpb2P81069 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gabpb2P81069 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gabpb2P81069 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gabpb2P81069 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gabpb2P81069 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Gabpb2P81069 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gabpb2P81069 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gabpb2P81069 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gabpb2P81069 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gabpb2P81069 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gabpb2P81069 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gabpb2P81069 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gabpb2P81069 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gabpb2P81069 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gabpb2P81069 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gabpb2P81069 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms