Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Irx3P81067 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Irx3P81067 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Irx3P81067 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Irx3P81067 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Irx3P81067 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Irx3P81067 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Irx3P81067 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Irx3P81067 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Irx3P81067 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Irx3P81067 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Irx3P81067 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Irx3P81067 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Irx3P81067 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Irx3P81067 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Irx3P81067 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Irx3P81067 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Irx3P81067 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Irx3P81067 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Irx3P81067 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Irx3P81067 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Irx3P81067 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Irx3P81067 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Irx3P81067 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Irx3P81067 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Irx3P81067 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Irx3P81067 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Irx3P81067 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Irx3P81067 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Irx3P81067 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Irx3P81067 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Irx3P81067 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Irx3P81067 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Irx3P81067 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Irx3P81067 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Irx3P81067 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Irx3P81067 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Irx3P81067 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Irx3P81067 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Irx3P81067 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Irx3P81067 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Irx3P81067 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Irx3P81067 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Irx3P81067 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Irx3P81067 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Irx3P81067 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Irx3P81067 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Irx3P81067 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Irx3P81067 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Irx3P81067 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Irx3P81067 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Irx3P81067 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Irx3P81067 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Irx3P81067 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Irx3P81067 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Irx3P81067 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Irx3P81067 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Irx3P81067 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Irx3P81067 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Irx3P81067 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Irx3P81067 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Irx3P81067 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Irx3P81067 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Irx3P81067 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Irx3P81067 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Irx3P81067 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Irx3P81067 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Irx3P81067 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Irx3P81067 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Irx3P81067 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Irx3P81067 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Irx3P81067 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Irx3P81067 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Irx3P81067 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Irx3P81067 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Irx3P81067 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Irx3P81067 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Irx3P81067 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Irx3P81067 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Irx3P81067 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Irx3P81067 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Irx3P81067 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Irx3P81067 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Irx3P81067 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Irx3P81067 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Irx3P81067 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Irx3P81067 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Irx3P81067 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Irx3P81067 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Irx3P81067 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Irx3P81067 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Irx3P81067 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Irx3P81067 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Irx3P81067 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Irx3P81067 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Irx3P81067 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Irx3P81067 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Irx3P81067 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Irx3P81067 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Irx3P81067 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms