Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vamp7P70280 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vamp7P70280 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vamp7P70280 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vamp7P70280 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vamp7P70280 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vamp7P70280 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vamp7P70280 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vamp7P70280 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Vamp7P70280 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Vamp7P70280 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vamp7P70280 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vamp7P70280 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vamp7P70280 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vamp7P70280 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vamp7P70280 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vamp7P70280 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vamp7P70280 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vamp7P70280 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vamp7P70280 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vamp7P70280 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vamp7P70280 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vamp7P70280 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vamp7P70280 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vamp7P70280 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Vamp7P70280 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vamp7P70280 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vamp7P70280 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vamp7P70280 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vamp7P70280 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vamp7P70280 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vamp7P70280 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vamp7P70280 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vamp7P70280 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vamp7P70280 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vamp7P70280 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vamp7P70280 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vamp7P70280 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vamp7P70280 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vamp7P70280 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vamp7P70280 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vamp7P70280 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vamp7P70280 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vamp7P70280 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vamp7P70280 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Vamp7P70280 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vamp7P70280 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vamp7P70280 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vamp7P70280 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Vamp7P70280 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vamp7P70280 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vamp7P70280 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vamp7P70280 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Vamp7P70280 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vamp7P70280 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vamp7P70280 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vamp7P70280 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vamp7P70280 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vamp7P70280 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vamp7P70280 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Vamp7P70280 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vamp7P70280 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vamp7P70280 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vamp7P70280 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vamp7P70280 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vamp7P70280 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vamp7P70280 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vamp7P70280 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vamp7P70280 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vamp7P70280 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vamp7P70280 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vamp7P70280 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vamp7P70280 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vamp7P70280 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vamp7P70280 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vamp7P70280 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vamp7P70280 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vamp7P70280 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vamp7P70280 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vamp7P70280 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vamp7P70280 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vamp7P70280 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vamp7P70280 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Vamp7P70280 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vamp7P70280 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vamp7P70280 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vamp7P70280 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vamp7P70280 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vamp7P70280 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vamp7P70280 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vamp7P70280 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vamp7P70280 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vamp7P70280 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vamp7P70280 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vamp7P70280 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vamp7P70280 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vamp7P70280 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vamp7P70280 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vamp7P70280 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vamp7P70280 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms