Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Chl1P70232 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Chl1P70232 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Chl1P70232 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Chl1P70232 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Chl1P70232 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Chl1P70232 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Chl1P70232 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Chl1P70232 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chl1P70232 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chl1P70232 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chl1P70232 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chl1P70232 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Chl1P70232 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chl1P70232 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chl1P70232 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chl1P70232 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chl1P70232 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Chl1P70232 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chl1P70232 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chl1P70232 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chl1P70232 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chl1P70232 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chl1P70232 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chl1P70232 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chl1P70232 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chl1P70232 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chl1P70232 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chl1P70232 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chl1P70232 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chl1P70232 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chl1P70232 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Chl1P70232 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chl1P70232 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chl1P70232 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chl1P70232 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chl1P70232 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chl1P70232 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chl1P70232 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chl1P70232 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chl1P70232 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chl1P70232 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chl1P70232 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chl1P70232 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chl1P70232 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chl1P70232 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chl1P70232 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chl1P70232 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chl1P70232 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chl1P70232 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chl1P70232 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chl1P70232 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Chl1P70232 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chl1P70232 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chl1P70232 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chl1P70232 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chl1P70232 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chl1P70232 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chl1P70232 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chl1P70232 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chl1P70232 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chl1P70232 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chl1P70232 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chl1P70232 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chl1P70232 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chl1P70232 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chl1P70232 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chl1P70232 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chl1P70232 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chl1P70232 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chl1P70232 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chl1P70232 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chl1P70232 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Chl1P70232 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Chl1P70232 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Chl1P70232 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Chl1P70232 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Chl1P70232 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Chl1P70232 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Chl1P70232 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Chl1P70232 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Chl1P70232 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Chl1P70232 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Chl1P70232 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Chl1P70232 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Chl1P70232 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Chl1P70232 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chl1P70232 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chl1P70232 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chl1P70232 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chl1P70232 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chl1P70232 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chl1P70232 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chl1P70232 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chl1P70232 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chl1P70232 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chl1P70232 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chl1P70232 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chl1P70232 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chl1P70232 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms