Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hoxd13P70217 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hoxd13P70217 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hoxd13P70217 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hoxd13P70217 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hoxd13P70217 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hoxd13P70217 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hoxd13P70217 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hoxd13P70217 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Hoxd13P70217 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hoxd13P70217 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hoxd13P70217 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hoxd13P70217 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxd13P70217 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxd13P70217 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxd13P70217 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxd13P70217 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxd13P70217 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxd13P70217 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxd13P70217 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxd13P70217 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxd13P70217 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxd13P70217 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxd13P70217 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxd13P70217 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxd13P70217 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxd13P70217 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxd13P70217 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxd13P70217 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hoxd13P70217 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hoxd13P70217 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hoxd13P70217 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hoxd13P70217 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hoxd13P70217 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hoxd13P70217 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hoxd13P70217 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hoxd13P70217 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hoxd13P70217 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hoxd13P70217 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hoxd13P70217 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hoxd13P70217 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hoxd13P70217 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hoxd13P70217 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hoxd13P70217 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hoxd13P70217 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hoxd13P70217 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hoxd13P70217 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hoxd13P70217 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hoxd13P70217 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hoxd13P70217 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hoxd13P70217 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hoxd13P70217 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hoxd13P70217 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hoxd13P70217 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hoxd13P70217 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hoxd13P70217 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hoxd13P70217 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hoxd13P70217 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hoxd13P70217 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hoxd13P70217 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hoxd13P70217 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hoxd13P70217 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hoxd13P70217 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hoxd13P70217 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Hoxd13P70217 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Hoxd13P70217 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hoxd13P70217 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hoxd13P70217 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hoxd13P70217 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hoxd13P70217 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxd13P70217 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxd13P70217 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxd13P70217 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxd13P70217 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxd13P70217 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxd13P70217 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxd13P70217 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxd13P70217 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxd13P70217 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxd13P70217 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxd13P70217 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxd13P70217 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxd13P70217 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxd13P70217 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hoxd13P70217 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hoxd13P70217 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hoxd13P70217 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hoxd13P70217 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxd13P70217 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxd13P70217 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxd13P70217 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxd13P70217 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxd13P70217 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxd13P70217 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxd13P70217 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxd13P70217 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxd13P70217 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxd13P70217 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxd13P70217 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxd13P70217 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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