Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SbdsP70122 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SbdsP70122 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SbdsP70122 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SbdsP70122 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SbdsP70122 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SbdsP70122 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SbdsP70122 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SbdsP70122 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SbdsP70122 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SbdsP70122 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SbdsP70122 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SbdsP70122 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SbdsP70122 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SbdsP70122 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SbdsP70122 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SbdsP70122 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SbdsP70122 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SbdsP70122 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SbdsP70122 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SbdsP70122 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SbdsP70122 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SbdsP70122 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SbdsP70122 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SbdsP70122 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SbdsP70122 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SbdsP70122 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SbdsP70122 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SbdsP70122 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SbdsP70122 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SbdsP70122 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SbdsP70122 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SbdsP70122 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SbdsP70122 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SbdsP70122 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SbdsP70122 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SbdsP70122 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SbdsP70122 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SbdsP70122 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SbdsP70122 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SbdsP70122 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SbdsP70122 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SbdsP70122 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SbdsP70122 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SbdsP70122 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SbdsP70122 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SbdsP70122 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SbdsP70122 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SbdsP70122 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SbdsP70122 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SbdsP70122 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SbdsP70122 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SbdsP70122 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SbdsP70122 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SbdsP70122 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SbdsP70122 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SbdsP70122 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SbdsP70122 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SbdsP70122 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SbdsP70122 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SbdsP70122 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SbdsP70122 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SbdsP70122 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SbdsP70122 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SbdsP70122 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SbdsP70122 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SbdsP70122 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SbdsP70122 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SbdsP70122 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SbdsP70122 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SbdsP70122 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SbdsP70122 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SbdsP70122 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SbdsP70122 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SbdsP70122 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SbdsP70122 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SbdsP70122 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SbdsP70122 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SbdsP70122 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SbdsP70122 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SbdsP70122 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SbdsP70122 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SbdsP70122 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SbdsP70122 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SbdsP70122 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SbdsP70122 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SbdsP70122 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SbdsP70122 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SbdsP70122 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SbdsP70122 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SbdsP70122 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SbdsP70122 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SbdsP70122 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SbdsP70122 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SbdsP70122 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SbdsP70122 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SbdsP70122 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SbdsP70122 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SbdsP70122 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SbdsP70122 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms