Protein–RNA interactions for Protein: P67871

Csnk2b, Casein kinase II subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2bP67871 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csnk2bP67871 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Csnk2bP67871 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Csnk2bP67871 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Csnk2bP67871 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Csnk2bP67871 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Csnk2bP67871 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Csnk2bP67871 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Csnk2bP67871 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Csnk2bP67871 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Csnk2bP67871 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Csnk2bP67871 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Csnk2bP67871 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Csnk2bP67871 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Csnk2bP67871 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Csnk2bP67871 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Csnk2bP67871 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Csnk2bP67871 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Csnk2bP67871 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Csnk2bP67871 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Csnk2bP67871 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csnk2bP67871 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csnk2bP67871 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csnk2bP67871 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csnk2bP67871 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Csnk2bP67871 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csnk2bP67871 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csnk2bP67871 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Csnk2bP67871 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csnk2bP67871 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csnk2bP67871 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csnk2bP67871 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csnk2bP67871 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csnk2bP67871 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csnk2bP67871 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csnk2bP67871 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csnk2bP67871 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csnk2bP67871 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csnk2bP67871 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csnk2bP67871 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csnk2bP67871 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csnk2bP67871 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csnk2bP67871 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csnk2bP67871 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csnk2bP67871 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csnk2bP67871 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csnk2bP67871 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csnk2bP67871 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csnk2bP67871 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Csnk2bP67871 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csnk2bP67871 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csnk2bP67871 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Csnk2bP67871 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csnk2bP67871 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csnk2bP67871 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csnk2bP67871 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csnk2bP67871 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csnk2bP67871 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csnk2bP67871 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csnk2bP67871 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csnk2bP67871 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Csnk2bP67871 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Csnk2bP67871 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Csnk2bP67871 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Csnk2bP67871 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Csnk2bP67871 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Csnk2bP67871 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Csnk2bP67871 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Csnk2bP67871 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csnk2bP67871 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csnk2bP67871 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csnk2bP67871 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csnk2bP67871 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csnk2bP67871 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csnk2bP67871 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csnk2bP67871 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csnk2bP67871 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csnk2bP67871 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Csnk2bP67871 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csnk2bP67871 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csnk2bP67871 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csnk2bP67871 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csnk2bP67871 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csnk2bP67871 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csnk2bP67871 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csnk2bP67871 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csnk2bP67871 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csnk2bP67871 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csnk2bP67871 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csnk2bP67871 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csnk2bP67871 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csnk2bP67871 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csnk2bP67871 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csnk2bP67871 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csnk2bP67871 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csnk2bP67871 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Csnk2bP67871 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csnk2bP67871 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csnk2bP67871 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csnk2bP67871 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms