Protein–RNA interactions for Protein: P63143

Kcnab1, Voltage-gated potassium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnab1P63143 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kcnab1P63143 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kcnab1P63143 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kcnab1P63143 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcnab1P63143 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcnab1P63143 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcnab1P63143 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcnab1P63143 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcnab1P63143 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcnab1P63143 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcnab1P63143 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcnab1P63143 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcnab1P63143 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcnab1P63143 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcnab1P63143 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnab1P63143 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnab1P63143 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnab1P63143 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnab1P63143 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnab1P63143 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnab1P63143 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnab1P63143 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnab1P63143 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnab1P63143 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnab1P63143 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnab1P63143 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnab1P63143 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnab1P63143 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnab1P63143 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kcnab1P63143 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kcnab1P63143 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kcnab1P63143 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kcnab1P63143 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kcnab1P63143 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kcnab1P63143 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kcnab1P63143 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Kcnab1P63143 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kcnab1P63143 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kcnab1P63143 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Kcnab1P63143 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Kcnab1P63143 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Kcnab1P63143 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kcnab1P63143 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kcnab1P63143 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kcnab1P63143 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kcnab1P63143 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kcnab1P63143 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kcnab1P63143 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kcnab1P63143 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kcnab1P63143 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kcnab1P63143 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kcnab1P63143 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnab1P63143 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnab1P63143 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnab1P63143 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnab1P63143 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnab1P63143 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnab1P63143 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnab1P63143 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnab1P63143 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnab1P63143 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnab1P63143 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnab1P63143 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnab1P63143 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kcnab1P63143 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kcnab1P63143 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Kcnab1P63143 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kcnab1P63143 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kcnab1P63143 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kcnab1P63143 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kcnab1P63143 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kcnab1P63143 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kcnab1P63143 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kcnab1P63143 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kcnab1P63143 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Kcnab1P63143 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kcnab1P63143 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kcnab1P63143 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kcnab1P63143 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kcnab1P63143 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kcnab1P63143 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kcnab1P63143 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kcnab1P63143 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kcnab1P63143 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kcnab1P63143 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kcnab1P63143 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kcnab1P63143 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kcnab1P63143 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kcnab1P63143 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kcnab1P63143 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kcnab1P63143 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kcnab1P63143 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kcnab1P63143 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kcnab1P63143 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kcnab1P63143 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kcnab1P63143 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kcnab1P63143 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kcnab1P63143 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kcnab1P63143 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kcnab1P63143 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms